Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CrxO54751 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CrxO54751 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CrxO54751 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CrxO54751 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CrxO54751 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CrxO54751 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CrxO54751 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CrxO54751 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CrxO54751 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CrxO54751 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CrxO54751 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CrxO54751 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CrxO54751 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CrxO54751 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CrxO54751 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CrxO54751 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CrxO54751 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CrxO54751 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CrxO54751 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CrxO54751 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CrxO54751 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CrxO54751 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CrxO54751 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CrxO54751 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CrxO54751 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CrxO54751 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CrxO54751 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CrxO54751 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CrxO54751 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CrxO54751 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CrxO54751 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CrxO54751 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CrxO54751 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CrxO54751 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CrxO54751 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CrxO54751 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CrxO54751 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CrxO54751 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CrxO54751 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CrxO54751 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CrxO54751 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CrxO54751 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CrxO54751 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CrxO54751 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CrxO54751 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CrxO54751 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CrxO54751 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CrxO54751 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CrxO54751 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CrxO54751 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CrxO54751 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CrxO54751 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CrxO54751 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CrxO54751 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CrxO54751 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CrxO54751 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CrxO54751 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CrxO54751 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CrxO54751 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CrxO54751 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CrxO54751 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CrxO54751 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CrxO54751 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CrxO54751 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CrxO54751 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CrxO54751 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CrxO54751 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CrxO54751 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CrxO54751 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CrxO54751 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CrxO54751 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CrxO54751 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CrxO54751 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CrxO54751 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CrxO54751 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CrxO54751 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CrxO54751 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CrxO54751 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CrxO54751 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CrxO54751 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CrxO54751 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CrxO54751 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CrxO54751 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CrxO54751 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CrxO54751 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CrxO54751 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CrxO54751 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CrxO54751 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CrxO54751 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CrxO54751 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CrxO54751 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CrxO54751 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CrxO54751 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CrxO54751 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CrxO54751 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CrxO54751 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CrxO54751 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CrxO54751 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CrxO54751 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms