Protein–RNA interactions for Protein: O54709

Klrk1, NKG2-D type II integral membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klrk1O54709 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Klrk1O54709 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Klrk1O54709 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Klrk1O54709 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Klrk1O54709 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Klrk1O54709 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Klrk1O54709 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Klrk1O54709 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Klrk1O54709 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Klrk1O54709 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Klrk1O54709 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Klrk1O54709 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Klrk1O54709 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Klrk1O54709 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Klrk1O54709 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Klrk1O54709 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Klrk1O54709 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Klrk1O54709 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Klrk1O54709 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Klrk1O54709 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Klrk1O54709 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Klrk1O54709 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Klrk1O54709 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Klrk1O54709 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Klrk1O54709 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Klrk1O54709 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Klrk1O54709 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Klrk1O54709 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Klrk1O54709 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Klrk1O54709 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Klrk1O54709 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Klrk1O54709 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Klrk1O54709 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Klrk1O54709 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Klrk1O54709 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Klrk1O54709 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Klrk1O54709 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Klrk1O54709 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Klrk1O54709 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Klrk1O54709 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Klrk1O54709 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Klrk1O54709 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Klrk1O54709 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Klrk1O54709 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Klrk1O54709 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Klrk1O54709 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Klrk1O54709 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Klrk1O54709 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Klrk1O54709 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Klrk1O54709 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Klrk1O54709 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Klrk1O54709 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Klrk1O54709 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Klrk1O54709 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Klrk1O54709 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Klrk1O54709 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Klrk1O54709 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Klrk1O54709 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Klrk1O54709 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Klrk1O54709 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Klrk1O54709 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Klrk1O54709 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Klrk1O54709 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Klrk1O54709 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Klrk1O54709 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Klrk1O54709 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Klrk1O54709 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Klrk1O54709 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Klrk1O54709 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Klrk1O54709 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Klrk1O54709 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Klrk1O54709 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Klrk1O54709 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Klrk1O54709 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Klrk1O54709 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Klrk1O54709 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Klrk1O54709 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Klrk1O54709 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Klrk1O54709 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Klrk1O54709 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Klrk1O54709 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Klrk1O54709 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Klrk1O54709 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Klrk1O54709 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Klrk1O54709 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Klrk1O54709 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Klrk1O54709 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Klrk1O54709 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Klrk1O54709 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Klrk1O54709 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Klrk1O54709 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Klrk1O54709 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Klrk1O54709 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Klrk1O54709 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Klrk1O54709 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Klrk1O54709 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Klrk1O54709 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Klrk1O54709 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Klrk1O54709 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Klrk1O54709 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms