Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sdc4O35988 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sdc4O35988 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sdc4O35988 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sdc4O35988 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sdc4O35988 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sdc4O35988 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sdc4O35988 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sdc4O35988 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sdc4O35988 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sdc4O35988 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Sdc4O35988 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sdc4O35988 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sdc4O35988 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sdc4O35988 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sdc4O35988 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sdc4O35988 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sdc4O35988 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sdc4O35988 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sdc4O35988 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sdc4O35988 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sdc4O35988 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sdc4O35988 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sdc4O35988 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sdc4O35988 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Sdc4O35988 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sdc4O35988 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sdc4O35988 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sdc4O35988 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sdc4O35988 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sdc4O35988 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sdc4O35988 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sdc4O35988 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sdc4O35988 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sdc4O35988 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sdc4O35988 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sdc4O35988 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sdc4O35988 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sdc4O35988 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sdc4O35988 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sdc4O35988 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sdc4O35988 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sdc4O35988 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Sdc4O35988 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Sdc4O35988 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sdc4O35988 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sdc4O35988 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Sdc4O35988 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Sdc4O35988 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sdc4O35988 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sdc4O35988 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sdc4O35988 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sdc4O35988 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sdc4O35988 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sdc4O35988 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sdc4O35988 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Sdc4O35988 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sdc4O35988 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sdc4O35988 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sdc4O35988 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sdc4O35988 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sdc4O35988 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sdc4O35988 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sdc4O35988 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sdc4O35988 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Sdc4O35988 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sdc4O35988 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sdc4O35988 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sdc4O35988 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sdc4O35988 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sdc4O35988 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sdc4O35988 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sdc4O35988 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sdc4O35988 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sdc4O35988 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sdc4O35988 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sdc4O35988 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sdc4O35988 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sdc4O35988 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sdc4O35988 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sdc4O35988 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Sdc4O35988 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sdc4O35988 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sdc4O35988 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sdc4O35988 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sdc4O35988 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sdc4O35988 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sdc4O35988 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sdc4O35988 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sdc4O35988 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sdc4O35988 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sdc4O35988 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sdc4O35988 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sdc4O35988 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sdc4O35988 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sdc4O35988 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sdc4O35988 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sdc4O35988 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sdc4O35988 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sdc4O35988 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms