Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bhlhe40O35185 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bhlhe40O35185 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bhlhe40O35185 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bhlhe40O35185 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bhlhe40O35185 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bhlhe40O35185 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bhlhe40O35185 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bhlhe40O35185 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bhlhe40O35185 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bhlhe40O35185 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bhlhe40O35185 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bhlhe40O35185 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bhlhe40O35185 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bhlhe40O35185 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bhlhe40O35185 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bhlhe40O35185 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bhlhe40O35185 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bhlhe40O35185 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bhlhe40O35185 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bhlhe40O35185 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bhlhe40O35185 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bhlhe40O35185 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bhlhe40O35185 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bhlhe40O35185 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bhlhe40O35185 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bhlhe40O35185 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bhlhe40O35185 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bhlhe40O35185 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bhlhe40O35185 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bhlhe40O35185 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bhlhe40O35185 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bhlhe40O35185 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bhlhe40O35185 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bhlhe40O35185 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bhlhe40O35185 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Bhlhe40O35185 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bhlhe40O35185 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bhlhe40O35185 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bhlhe40O35185 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Bhlhe40O35185 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Bhlhe40O35185 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bhlhe40O35185 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bhlhe40O35185 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bhlhe40O35185 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bhlhe40O35185 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bhlhe40O35185 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bhlhe40O35185 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bhlhe40O35185 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bhlhe40O35185 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bhlhe40O35185 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bhlhe40O35185 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Bhlhe40O35185 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bhlhe40O35185 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bhlhe40O35185 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bhlhe40O35185 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bhlhe40O35185 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Bhlhe40O35185 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bhlhe40O35185 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bhlhe40O35185 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bhlhe40O35185 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bhlhe40O35185 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bhlhe40O35185 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bhlhe40O35185 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bhlhe40O35185 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bhlhe40O35185 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bhlhe40O35185 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Bhlhe40O35185 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bhlhe40O35185 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bhlhe40O35185 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bhlhe40O35185 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bhlhe40O35185 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bhlhe40O35185 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bhlhe40O35185 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bhlhe40O35185 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bhlhe40O35185 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bhlhe40O35185 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Bhlhe40O35185 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bhlhe40O35185 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bhlhe40O35185 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bhlhe40O35185 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bhlhe40O35185 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bhlhe40O35185 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bhlhe40O35185 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bhlhe40O35185 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Bhlhe40O35185 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bhlhe40O35185 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bhlhe40O35185 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bhlhe40O35185 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bhlhe40O35185 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Bhlhe40O35185 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bhlhe40O35185 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bhlhe40O35185 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bhlhe40O35185 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bhlhe40O35185 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bhlhe40O35185 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bhlhe40O35185 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bhlhe40O35185 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bhlhe40O35185 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bhlhe40O35185 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms