Protein–RNA interactions for Protein: O08976

Pbsn, Probasin, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PbsnO08976 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PbsnO08976 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PbsnO08976 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PbsnO08976 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PbsnO08976 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PbsnO08976 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PbsnO08976 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PbsnO08976 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PbsnO08976 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PbsnO08976 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PbsnO08976 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PbsnO08976 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PbsnO08976 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PbsnO08976 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PbsnO08976 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PbsnO08976 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PbsnO08976 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PbsnO08976 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PbsnO08976 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PbsnO08976 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PbsnO08976 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PbsnO08976 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PbsnO08976 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PbsnO08976 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PbsnO08976 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PbsnO08976 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PbsnO08976 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PbsnO08976 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PbsnO08976 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PbsnO08976 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PbsnO08976 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PbsnO08976 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PbsnO08976 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PbsnO08976 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PbsnO08976 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PbsnO08976 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PbsnO08976 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PbsnO08976 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PbsnO08976 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PbsnO08976 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PbsnO08976 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PbsnO08976 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PbsnO08976 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PbsnO08976 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PbsnO08976 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PbsnO08976 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PbsnO08976 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PbsnO08976 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PbsnO08976 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PbsnO08976 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PbsnO08976 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PbsnO08976 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PbsnO08976 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PbsnO08976 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PbsnO08976 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PbsnO08976 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PbsnO08976 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PbsnO08976 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PbsnO08976 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PbsnO08976 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PbsnO08976 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PbsnO08976 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PbsnO08976 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PbsnO08976 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PbsnO08976 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PbsnO08976 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PbsnO08976 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PbsnO08976 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PbsnO08976 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PbsnO08976 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PbsnO08976 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PbsnO08976 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PbsnO08976 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PbsnO08976 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PbsnO08976 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PbsnO08976 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PbsnO08976 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PbsnO08976 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PbsnO08976 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PbsnO08976 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PbsnO08976 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PbsnO08976 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PbsnO08976 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PbsnO08976 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PbsnO08976 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PbsnO08976 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PbsnO08976 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PbsnO08976 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PbsnO08976 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PbsnO08976 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PbsnO08976 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PbsnO08976 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PbsnO08976 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PbsnO08976 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PbsnO08976 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PbsnO08976 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PbsnO08976 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PbsnO08976 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PbsnO08976 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PbsnO08976 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms