Protein–RNA interactions for Protein: O08574

Mesp2, Mesoderm posterior protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp2O08574 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mesp2O08574 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mesp2O08574 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Mesp2O08574 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mesp2O08574 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mesp2O08574 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mesp2O08574 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mesp2O08574 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mesp2O08574 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mesp2O08574 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mesp2O08574 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mesp2O08574 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mesp2O08574 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mesp2O08574 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mesp2O08574 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mesp2O08574 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mesp2O08574 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Mesp2O08574 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mesp2O08574 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mesp2O08574 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mesp2O08574 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mesp2O08574 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mesp2O08574 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mesp2O08574 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mesp2O08574 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mesp2O08574 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mesp2O08574 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mesp2O08574 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mesp2O08574 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mesp2O08574 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mesp2O08574 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mesp2O08574 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mesp2O08574 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Mesp2O08574 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mesp2O08574 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mesp2O08574 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mesp2O08574 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mesp2O08574 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mesp2O08574 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mesp2O08574 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mesp2O08574 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Mesp2O08574 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mesp2O08574 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mesp2O08574 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mesp2O08574 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mesp2O08574 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mesp2O08574 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Mesp2O08574 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mesp2O08574 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Mesp2O08574 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mesp2O08574 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mesp2O08574 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mesp2O08574 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mesp2O08574 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mesp2O08574 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mesp2O08574 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Mesp2O08574 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mesp2O08574 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mesp2O08574 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mesp2O08574 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Mesp2O08574 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mesp2O08574 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mesp2O08574 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mesp2O08574 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mesp2O08574 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mesp2O08574 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mesp2O08574 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mesp2O08574 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mesp2O08574 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mesp2O08574 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mesp2O08574 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mesp2O08574 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mesp2O08574 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mesp2O08574 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mesp2O08574 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mesp2O08574 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mesp2O08574 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mesp2O08574 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mesp2O08574 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mesp2O08574 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mesp2O08574 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mesp2O08574 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mesp2O08574 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mesp2O08574 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mesp2O08574 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mesp2O08574 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mesp2O08574 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mesp2O08574 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mesp2O08574 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mesp2O08574 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mesp2O08574 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mesp2O08574 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mesp2O08574 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mesp2O08574 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mesp2O08574 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mesp2O08574 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mesp2O08574 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mesp2O08574 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mesp2O08574 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mesp2O08574 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms