Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm3542K7N6U2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm3542K7N6U2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm3542K7N6U2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm3542K7N6U2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm3542K7N6U2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm3542K7N6U2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm3542K7N6U2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm3542K7N6U2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm3542K7N6U2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3542K7N6U2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3542K7N6U2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3542K7N6U2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3542K7N6U2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm3542K7N6U2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3542K7N6U2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3542K7N6U2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3542K7N6U2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3542K7N6U2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3542K7N6U2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3542K7N6U2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3542K7N6U2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3542K7N6U2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3542K7N6U2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3542K7N6U2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3542K7N6U2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3542K7N6U2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3542K7N6U2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3542K7N6U2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3542K7N6U2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3542K7N6U2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3542K7N6U2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3542K7N6U2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3542K7N6U2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm3542K7N6U2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm3542K7N6U2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm3542K7N6U2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm3542K7N6U2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3542K7N6U2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3542K7N6U2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3542K7N6U2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3542K7N6U2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3542K7N6U2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3542K7N6U2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3542K7N6U2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3542K7N6U2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3542K7N6U2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3542K7N6U2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3542K7N6U2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3542K7N6U2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3542K7N6U2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3542K7N6U2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3542K7N6U2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3542K7N6U2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3542K7N6U2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3542K7N6U2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3542K7N6U2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm3542K7N6U2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm3542K7N6U2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm3542K7N6U2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3542K7N6U2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3542K7N6U2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3542K7N6U2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3542K7N6U2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3542K7N6U2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3542K7N6U2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3542K7N6U2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3542K7N6U2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3542K7N6U2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3542K7N6U2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3542K7N6U2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3542K7N6U2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3542K7N6U2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3542K7N6U2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3542K7N6U2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3542K7N6U2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3542K7N6U2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3542K7N6U2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3542K7N6U2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3542K7N6U2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3542K7N6U2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3542K7N6U2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3542K7N6U2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm3542K7N6U2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Gm3542K7N6U2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Gm3542K7N6U2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3542K7N6U2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3542K7N6U2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3542K7N6U2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3542K7N6U2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3542K7N6U2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3542K7N6U2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3542K7N6U2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3542K7N6U2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3542K7N6U2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3542K7N6U2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3542K7N6U2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3542K7N6U2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3542K7N6U2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3542K7N6U2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms