Protein–RNA interactions for Protein: J3QMI4

Calhm3, Calcium homeostasis modulator 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calhm3J3QMI4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Calhm3J3QMI4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Calhm3J3QMI4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Calhm3J3QMI4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Calhm3J3QMI4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Calhm3J3QMI4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Calhm3J3QMI4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Calhm3J3QMI4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Calhm3J3QMI4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Calhm3J3QMI4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Calhm3J3QMI4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Calhm3J3QMI4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Calhm3J3QMI4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Calhm3J3QMI4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Calhm3J3QMI4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Calhm3J3QMI4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Calhm3J3QMI4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Calhm3J3QMI4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Calhm3J3QMI4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Calhm3J3QMI4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Calhm3J3QMI4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Calhm3J3QMI4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Calhm3J3QMI4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Calhm3J3QMI4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Calhm3J3QMI4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Calhm3J3QMI4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Calhm3J3QMI4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Calhm3J3QMI4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Calhm3J3QMI4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Calhm3J3QMI4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Calhm3J3QMI4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Calhm3J3QMI4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Calhm3J3QMI4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Calhm3J3QMI4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Calhm3J3QMI4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Calhm3J3QMI4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Calhm3J3QMI4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Calhm3J3QMI4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Calhm3J3QMI4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Calhm3J3QMI4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Calhm3J3QMI4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Calhm3J3QMI4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Calhm3J3QMI4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Calhm3J3QMI4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Calhm3J3QMI4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Calhm3J3QMI4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Calhm3J3QMI4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Calhm3J3QMI4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Calhm3J3QMI4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Calhm3J3QMI4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Calhm3J3QMI4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Calhm3J3QMI4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Calhm3J3QMI4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Calhm3J3QMI4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Calhm3J3QMI4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Calhm3J3QMI4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Calhm3J3QMI4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Calhm3J3QMI4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Calhm3J3QMI4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Calhm3J3QMI4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Calhm3J3QMI4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Calhm3J3QMI4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Calhm3J3QMI4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Calhm3J3QMI4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Calhm3J3QMI4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Calhm3J3QMI4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Calhm3J3QMI4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Calhm3J3QMI4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Calhm3J3QMI4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Calhm3J3QMI4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Calhm3J3QMI4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Calhm3J3QMI4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Calhm3J3QMI4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Calhm3J3QMI4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Calhm3J3QMI4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Calhm3J3QMI4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Calhm3J3QMI4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Calhm3J3QMI4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Calhm3J3QMI4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Calhm3J3QMI4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Calhm3J3QMI4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Calhm3J3QMI4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Calhm3J3QMI4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Calhm3J3QMI4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Calhm3J3QMI4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Calhm3J3QMI4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Calhm3J3QMI4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Calhm3J3QMI4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Calhm3J3QMI4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Calhm3J3QMI4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Calhm3J3QMI4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Calhm3J3QMI4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Calhm3J3QMI4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Calhm3J3QMI4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Calhm3J3QMI4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Calhm3J3QMI4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Calhm3J3QMI4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Calhm3J3QMI4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Calhm3J3QMI4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Calhm3J3QMI4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms