Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmem200cJ3QK46 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmem200cJ3QK46 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmem200cJ3QK46 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmem200cJ3QK46 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmem200cJ3QK46 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmem200cJ3QK46 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmem200cJ3QK46 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmem200cJ3QK46 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmem200cJ3QK46 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmem200cJ3QK46 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmem200cJ3QK46 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmem200cJ3QK46 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmem200cJ3QK46 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmem200cJ3QK46 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmem200cJ3QK46 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmem200cJ3QK46 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmem200cJ3QK46 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmem200cJ3QK46 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmem200cJ3QK46 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmem200cJ3QK46 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmem200cJ3QK46 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tmem200cJ3QK46 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmem200cJ3QK46 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmem200cJ3QK46 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmem200cJ3QK46 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmem200cJ3QK46 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmem200cJ3QK46 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmem200cJ3QK46 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmem200cJ3QK46 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmem200cJ3QK46 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmem200cJ3QK46 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmem200cJ3QK46 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmem200cJ3QK46 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmem200cJ3QK46 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmem200cJ3QK46 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmem200cJ3QK46 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmem200cJ3QK46 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmem200cJ3QK46 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmem200cJ3QK46 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmem200cJ3QK46 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmem200cJ3QK46 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem200cJ3QK46 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem200cJ3QK46 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem200cJ3QK46 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem200cJ3QK46 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem200cJ3QK46 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem200cJ3QK46 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem200cJ3QK46 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem200cJ3QK46 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem200cJ3QK46 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem200cJ3QK46 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem200cJ3QK46 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem200cJ3QK46 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem200cJ3QK46 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem200cJ3QK46 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem200cJ3QK46 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem200cJ3QK46 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem200cJ3QK46 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem200cJ3QK46 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem200cJ3QK46 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem200cJ3QK46 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem200cJ3QK46 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem200cJ3QK46 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem200cJ3QK46 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem200cJ3QK46 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem200cJ3QK46 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem200cJ3QK46 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem200cJ3QK46 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem200cJ3QK46 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem200cJ3QK46 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem200cJ3QK46 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem200cJ3QK46 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem200cJ3QK46 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem200cJ3QK46 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem200cJ3QK46 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem200cJ3QK46 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem200cJ3QK46 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem200cJ3QK46 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem200cJ3QK46 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem200cJ3QK46 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem200cJ3QK46 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem200cJ3QK46 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem200cJ3QK46 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem200cJ3QK46 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem200cJ3QK46 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem200cJ3QK46 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem200cJ3QK46 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem200cJ3QK46 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem200cJ3QK46 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem200cJ3QK46 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem200cJ3QK46 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem200cJ3QK46 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem200cJ3QK46 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem200cJ3QK46 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem200cJ3QK46 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem200cJ3QK46 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem200cJ3QK46 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem200cJ3QK46 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem200cJ3QK46 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms