Protein–RNA interactions for Protein: H3BJ88

Vmn2r3, Vomeronasal 2, receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r3H3BJ88 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn2r3H3BJ88 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn2r3H3BJ88 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn2r3H3BJ88 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn2r3H3BJ88 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn2r3H3BJ88 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn2r3H3BJ88 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn2r3H3BJ88 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn2r3H3BJ88 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn2r3H3BJ88 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn2r3H3BJ88 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn2r3H3BJ88 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn2r3H3BJ88 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn2r3H3BJ88 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn2r3H3BJ88 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn2r3H3BJ88 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn2r3H3BJ88 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Vmn2r3H3BJ88 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Vmn2r3H3BJ88 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r3H3BJ88 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r3H3BJ88 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r3H3BJ88 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r3H3BJ88 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r3H3BJ88 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn2r3H3BJ88 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn2r3H3BJ88 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn2r3H3BJ88 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn2r3H3BJ88 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn2r3H3BJ88 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn2r3H3BJ88 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn2r3H3BJ88 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r3H3BJ88 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r3H3BJ88 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn2r3H3BJ88 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn2r3H3BJ88 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn2r3H3BJ88 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn2r3H3BJ88 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn2r3H3BJ88 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn2r3H3BJ88 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn2r3H3BJ88 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn2r3H3BJ88 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn2r3H3BJ88 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn2r3H3BJ88 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn2r3H3BJ88 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn2r3H3BJ88 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn2r3H3BJ88 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn2r3H3BJ88 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn2r3H3BJ88 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn2r3H3BJ88 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn2r3H3BJ88 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn2r3H3BJ88 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn2r3H3BJ88 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn2r3H3BJ88 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn2r3H3BJ88 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn2r3H3BJ88 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn2r3H3BJ88 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn2r3H3BJ88 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn2r3H3BJ88 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn2r3H3BJ88 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn2r3H3BJ88 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn2r3H3BJ88 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn2r3H3BJ88 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vmn2r3H3BJ88 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn2r3H3BJ88 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r3H3BJ88 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r3H3BJ88 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r3H3BJ88 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r3H3BJ88 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r3H3BJ88 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r3H3BJ88 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r3H3BJ88 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn2r3H3BJ88 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn2r3H3BJ88 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn2r3H3BJ88 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn2r3H3BJ88 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn2r3H3BJ88 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn2r3H3BJ88 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn2r3H3BJ88 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn2r3H3BJ88 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn2r3H3BJ88 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn2r3H3BJ88 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn2r3H3BJ88 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn2r3H3BJ88 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn2r3H3BJ88 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn2r3H3BJ88 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn2r3H3BJ88 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn2r3H3BJ88 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn2r3H3BJ88 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn2r3H3BJ88 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn2r3H3BJ88 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn2r3H3BJ88 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn2r3H3BJ88 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn2r3H3BJ88 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn2r3H3BJ88 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vmn2r3H3BJ88 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn2r3H3BJ88 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn2r3H3BJ88 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn2r3H3BJ88 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn2r3H3BJ88 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn2r3H3BJ88 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms