Protein–RNA interactions for Protein: G5E870

Trip12, E3 ubiquitin-protein ligase TRIP12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip12G5E870 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trip12G5E870 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trip12G5E870 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Trip12G5E870 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trip12G5E870 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip12G5E870 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip12G5E870 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip12G5E870 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip12G5E870 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip12G5E870 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip12G5E870 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip12G5E870 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip12G5E870 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip12G5E870 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip12G5E870 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip12G5E870 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip12G5E870 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trip12G5E870 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trip12G5E870 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Trip12G5E870 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Trip12G5E870 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trip12G5E870 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trip12G5E870 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trip12G5E870 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trip12G5E870 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trip12G5E870 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trip12G5E870 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trip12G5E870 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trip12G5E870 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trip12G5E870 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trip12G5E870 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trip12G5E870 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trip12G5E870 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trip12G5E870 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trip12G5E870 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trip12G5E870 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trip12G5E870 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trip12G5E870 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trip12G5E870 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trip12G5E870 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Trip12G5E870 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trip12G5E870 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trip12G5E870 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trip12G5E870 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Trip12G5E870 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Trip12G5E870 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trip12G5E870 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trip12G5E870 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trip12G5E870 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trip12G5E870 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trip12G5E870 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Trip12G5E870 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trip12G5E870 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trip12G5E870 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trip12G5E870 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trip12G5E870 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trip12G5E870 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trip12G5E870 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trip12G5E870 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trip12G5E870 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Trip12G5E870 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Trip12G5E870 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Trip12G5E870 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trip12G5E870 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trip12G5E870 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trip12G5E870 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trip12G5E870 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trip12G5E870 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trip12G5E870 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trip12G5E870 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trip12G5E870 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trip12G5E870 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trip12G5E870 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trip12G5E870 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trip12G5E870 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trip12G5E870 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trip12G5E870 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trip12G5E870 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trip12G5E870 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trip12G5E870 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Trip12G5E870 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trip12G5E870 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trip12G5E870 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trip12G5E870 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trip12G5E870 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trip12G5E870 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Trip12G5E870 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trip12G5E870 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trip12G5E870 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trip12G5E870 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trip12G5E870 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trip12G5E870 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trip12G5E870 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trip12G5E870 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Trip12G5E870 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trip12G5E870 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Trip12G5E870 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trip12G5E870 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trip12G5E870 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Trip12G5E870 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms