Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nccrp1G3X9C2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nccrp1G3X9C2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nccrp1G3X9C2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nccrp1G3X9C2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nccrp1G3X9C2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nccrp1G3X9C2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nccrp1G3X9C2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Nccrp1G3X9C2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Nccrp1G3X9C2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nccrp1G3X9C2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nccrp1G3X9C2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nccrp1G3X9C2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nccrp1G3X9C2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nccrp1G3X9C2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nccrp1G3X9C2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nccrp1G3X9C2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Nccrp1G3X9C2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Nccrp1G3X9C2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nccrp1G3X9C2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nccrp1G3X9C2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Nccrp1G3X9C2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nccrp1G3X9C2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nccrp1G3X9C2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nccrp1G3X9C2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nccrp1G3X9C2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nccrp1G3X9C2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nccrp1G3X9C2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nccrp1G3X9C2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nccrp1G3X9C2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nccrp1G3X9C2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nccrp1G3X9C2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nccrp1G3X9C2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Nccrp1G3X9C2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nccrp1G3X9C2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nccrp1G3X9C2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nccrp1G3X9C2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nccrp1G3X9C2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nccrp1G3X9C2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Nccrp1G3X9C2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Nccrp1G3X9C2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Nccrp1G3X9C2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nccrp1G3X9C2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nccrp1G3X9C2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nccrp1G3X9C2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nccrp1G3X9C2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nccrp1G3X9C2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Nccrp1G3X9C2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nccrp1G3X9C2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nccrp1G3X9C2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nccrp1G3X9C2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nccrp1G3X9C2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nccrp1G3X9C2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nccrp1G3X9C2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nccrp1G3X9C2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nccrp1G3X9C2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Nccrp1G3X9C2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nccrp1G3X9C2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nccrp1G3X9C2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nccrp1G3X9C2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nccrp1G3X9C2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nccrp1G3X9C2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nccrp1G3X9C2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nccrp1G3X9C2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nccrp1G3X9C2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nccrp1G3X9C2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nccrp1G3X9C2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nccrp1G3X9C2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nccrp1G3X9C2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nccrp1G3X9C2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nccrp1G3X9C2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nccrp1G3X9C2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nccrp1G3X9C2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nccrp1G3X9C2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nccrp1G3X9C2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Nccrp1G3X9C2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Nccrp1G3X9C2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nccrp1G3X9C2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nccrp1G3X9C2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nccrp1G3X9C2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nccrp1G3X9C2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nccrp1G3X9C2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nccrp1G3X9C2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nccrp1G3X9C2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nccrp1G3X9C2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nccrp1G3X9C2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nccrp1G3X9C2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nccrp1G3X9C2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nccrp1G3X9C2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nccrp1G3X9C2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nccrp1G3X9C2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nccrp1G3X9C2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nccrp1G3X9C2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nccrp1G3X9C2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nccrp1G3X9C2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nccrp1G3X9C2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nccrp1G3X9C2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nccrp1G3X9C2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nccrp1G3X9C2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nccrp1G3X9C2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms