Protein–RNA interactions for Protein: G3UW31

Vmn1r176, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r176G3UW31 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vmn1r176G3UW31 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Vmn1r176G3UW31 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vmn1r176G3UW31 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vmn1r176G3UW31 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vmn1r176G3UW31 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vmn1r176G3UW31 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vmn1r176G3UW31 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vmn1r176G3UW31 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vmn1r176G3UW31 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vmn1r176G3UW31 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn1r176G3UW31 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vmn1r176G3UW31 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn1r176G3UW31 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn1r176G3UW31 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn1r176G3UW31 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn1r176G3UW31 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn1r176G3UW31 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn1r176G3UW31 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn1r176G3UW31 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn1r176G3UW31 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn1r176G3UW31 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vmn1r176G3UW31 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Vmn1r176G3UW31 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Vmn1r176G3UW31 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vmn1r176G3UW31 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vmn1r176G3UW31 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vmn1r176G3UW31 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Vmn1r176G3UW31 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vmn1r176G3UW31 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Vmn1r176G3UW31 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vmn1r176G3UW31 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Vmn1r176G3UW31 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vmn1r176G3UW31 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmn1r176G3UW31 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmn1r176G3UW31 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmn1r176G3UW31 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmn1r176G3UW31 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmn1r176G3UW31 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vmn1r176G3UW31 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vmn1r176G3UW31 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vmn1r176G3UW31 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vmn1r176G3UW31 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vmn1r176G3UW31 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vmn1r176G3UW31 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vmn1r176G3UW31 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vmn1r176G3UW31 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn1r176G3UW31 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn1r176G3UW31 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn1r176G3UW31 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn1r176G3UW31 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn1r176G3UW31 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn1r176G3UW31 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn1r176G3UW31 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn1r176G3UW31 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn1r176G3UW31 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn1r176G3UW31 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn1r176G3UW31 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn1r176G3UW31 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn1r176G3UW31 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn1r176G3UW31 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn1r176G3UW31 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn1r176G3UW31 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn1r176G3UW31 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn1r176G3UW31 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmn1r176G3UW31 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vmn1r176G3UW31 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vmn1r176G3UW31 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn1r176G3UW31 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn1r176G3UW31 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn1r176G3UW31 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn1r176G3UW31 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn1r176G3UW31 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn1r176G3UW31 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn1r176G3UW31 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn1r176G3UW31 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn1r176G3UW31 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn1r176G3UW31 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn1r176G3UW31 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn1r176G3UW31 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn1r176G3UW31 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn1r176G3UW31 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn1r176G3UW31 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn1r176G3UW31 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmn1r176G3UW31 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmn1r176G3UW31 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vmn1r176G3UW31 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vmn1r176G3UW31 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vmn1r176G3UW31 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Vmn1r176G3UW31 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn1r176G3UW31 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn1r176G3UW31 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn1r176G3UW31 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn1r176G3UW31 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn1r176G3UW31 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn1r176G3UW31 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn1r176G3UW31 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn1r176G3UW31 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn1r176G3UW31 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn1r176G3UW31 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms