Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
Ercc6F8VPZ5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
Ercc6F8VPZ5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
Ercc6F8VPZ5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
Ercc6F8VPZ5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
Ercc6F8VPZ5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
Ercc6F8VPZ5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
Ercc6F8VPZ5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC41.37■■■■■ 4.21
Ercc6F8VPZ5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
Ercc6F8VPZ5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
Ercc6F8VPZ5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
Ercc6F8VPZ5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC41.35■■■■■ 4.21
Ercc6F8VPZ5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
Ercc6F8VPZ5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
Ercc6F8VPZ5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
Ercc6F8VPZ5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC41.33■■■■■ 4.21
Ercc6F8VPZ5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
Ercc6F8VPZ5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC41.33■■■■■ 4.21
Ercc6F8VPZ5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.32■■■■■ 4.2
Ercc6F8VPZ5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
Ercc6F8VPZ5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.3■■■■■ 4.2
Ercc6F8VPZ5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
Ercc6F8VPZ5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
Ercc6F8VPZ5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC41.29■■■■■ 4.2
Ercc6F8VPZ5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
Ercc6F8VPZ5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
Ercc6F8VPZ5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
Ercc6F8VPZ5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
Ercc6F8VPZ5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
Ercc6F8VPZ5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
Ercc6F8VPZ5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC41.27■■■■■ 4.2
Ercc6F8VPZ5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
Ercc6F8VPZ5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC41.26■■■■■ 4.2
Ercc6F8VPZ5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC41.26■■■■■ 4.2
Ercc6F8VPZ5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.26■■■■■ 4.2
Ercc6F8VPZ5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC41.26■■■■■ 4.2
Ercc6F8VPZ5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.19
Ercc6F8VPZ5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
Ercc6F8VPZ5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
Ercc6F8VPZ5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC41.23■■■■■ 4.19
Ercc6F8VPZ5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
Ercc6F8VPZ5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC41.22■■■■■ 4.19
Ercc6F8VPZ5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
Ercc6F8VPZ5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
Ercc6F8VPZ5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
Ercc6F8VPZ5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.19
Ercc6F8VPZ5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC41.2■■■■■ 4.19
Ercc6F8VPZ5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
Ercc6F8VPZ5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
Ercc6F8VPZ5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.19
Ercc6F8VPZ5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
Ercc6F8VPZ5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
Ercc6F8VPZ5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC41.19■■■■■ 4.18
Ercc6F8VPZ5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
Ercc6F8VPZ5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC41.18■■■■■ 4.18
Ercc6F8VPZ5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC41.16■■■■■ 4.18
Ercc6F8VPZ5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
Ercc6F8VPZ5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
Ercc6F8VPZ5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
Ercc6F8VPZ5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC41.14■■■■■ 4.18
Ercc6F8VPZ5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC41.14■■■■■ 4.18
Ercc6F8VPZ5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
Ercc6F8VPZ5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC41.12■■■■■ 4.17
Ercc6F8VPZ5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
Ercc6F8VPZ5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
Ercc6F8VPZ5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
Ercc6F8VPZ5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
Ercc6F8VPZ5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
Ercc6F8VPZ5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
Ercc6F8VPZ5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.09■■■■■ 4.17
Ercc6F8VPZ5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC41.09■■■■■ 4.17
Ercc6F8VPZ5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
Ercc6F8VPZ5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
Ercc6F8VPZ5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
Ercc6F8VPZ5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
Ercc6F8VPZ5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC41.07■■■■■ 4.16
Ercc6F8VPZ5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC41.07■■■■■ 4.16
Ercc6F8VPZ5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC41.05■■■■■ 4.16
Ercc6F8VPZ5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.05■■■■■ 4.16
Ercc6F8VPZ5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
Ercc6F8VPZ5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.04■■■■■ 4.16
Ercc6F8VPZ5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
Ercc6F8VPZ5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
Ercc6F8VPZ5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
Ercc6F8VPZ5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
Ercc6F8VPZ5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
Ercc6F8VPZ5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
Ercc6F8VPZ5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
Ercc6F8VPZ5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC41■■■■■ 4.15
Ercc6F8VPZ5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
Ercc6F8VPZ5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
Ercc6F8VPZ5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.99■■■■■ 4.15
Ercc6F8VPZ5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Ercc6F8VPZ5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Ercc6F8VPZ5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Ercc6F8VPZ5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
Ercc6F8VPZ5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC40.97■■■■■ 4.15
Ercc6F8VPZ5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
Ercc6F8VPZ5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC40.96■■■■■ 4.15
Ercc6F8VPZ5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC40.96■■■■■ 4.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms