Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp9yF8VPU6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp9yF8VPU6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp9yF8VPU6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp9yF8VPU6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp9yF8VPU6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp9yF8VPU6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp9yF8VPU6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp9yF8VPU6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp9yF8VPU6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp9yF8VPU6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp9yF8VPU6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp9yF8VPU6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp9yF8VPU6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp9yF8VPU6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp9yF8VPU6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp9yF8VPU6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp9yF8VPU6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp9yF8VPU6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp9yF8VPU6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp9yF8VPU6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp9yF8VPU6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp9yF8VPU6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp9yF8VPU6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp9yF8VPU6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp9yF8VPU6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp9yF8VPU6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp9yF8VPU6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp9yF8VPU6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp9yF8VPU6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp9yF8VPU6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp9yF8VPU6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp9yF8VPU6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp9yF8VPU6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp9yF8VPU6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp9yF8VPU6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp9yF8VPU6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp9yF8VPU6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp9yF8VPU6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp9yF8VPU6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp9yF8VPU6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp9yF8VPU6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp9yF8VPU6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp9yF8VPU6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp9yF8VPU6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp9yF8VPU6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp9yF8VPU6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp9yF8VPU6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp9yF8VPU6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp9yF8VPU6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Usp9yF8VPU6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp9yF8VPU6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp9yF8VPU6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp9yF8VPU6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp9yF8VPU6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp9yF8VPU6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp9yF8VPU6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp9yF8VPU6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp9yF8VPU6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp9yF8VPU6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp9yF8VPU6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp9yF8VPU6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp9yF8VPU6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp9yF8VPU6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp9yF8VPU6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp9yF8VPU6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp9yF8VPU6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp9yF8VPU6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp9yF8VPU6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp9yF8VPU6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp9yF8VPU6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp9yF8VPU6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp9yF8VPU6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp9yF8VPU6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp9yF8VPU6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp9yF8VPU6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp9yF8VPU6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp9yF8VPU6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp9yF8VPU6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp9yF8VPU6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp9yF8VPU6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp9yF8VPU6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp9yF8VPU6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp9yF8VPU6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp9yF8VPU6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp9yF8VPU6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp9yF8VPU6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp9yF8VPU6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp9yF8VPU6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp9yF8VPU6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp9yF8VPU6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp9yF8VPU6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp9yF8VPU6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp9yF8VPU6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp9yF8VPU6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp9yF8VPU6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp9yF8VPU6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp9yF8VPU6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp9yF8VPU6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp9yF8VPU6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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