Protein–RNA interactions for Protein: F8VPJ6

Rfx7, Regulatory factor X, 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx7F8VPJ6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
Rfx7F8VPJ6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Rfx7F8VPJ6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Rfx7F8VPJ6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Rfx7F8VPJ6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Rfx7F8VPJ6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
Rfx7F8VPJ6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
Rfx7F8VPJ6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Rfx7F8VPJ6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
Rfx7F8VPJ6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
Rfx7F8VPJ6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Rfx7F8VPJ6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Rfx7F8VPJ6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Rfx7F8VPJ6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Rfx7F8VPJ6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Rfx7F8VPJ6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Rfx7F8VPJ6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Rfx7F8VPJ6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Rfx7F8VPJ6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Rfx7F8VPJ6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Rfx7F8VPJ6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Rfx7F8VPJ6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Rfx7F8VPJ6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Rfx7F8VPJ6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Rfx7F8VPJ6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Rfx7F8VPJ6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Rfx7F8VPJ6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Rfx7F8VPJ6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Rfx7F8VPJ6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Rfx7F8VPJ6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Rfx7F8VPJ6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Rfx7F8VPJ6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Rfx7F8VPJ6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Rfx7F8VPJ6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Rfx7F8VPJ6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
Rfx7F8VPJ6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Rfx7F8VPJ6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Rfx7F8VPJ6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
Rfx7F8VPJ6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Rfx7F8VPJ6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Rfx7F8VPJ6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Rfx7F8VPJ6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Rfx7F8VPJ6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Rfx7F8VPJ6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Rfx7F8VPJ6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Rfx7F8VPJ6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Rfx7F8VPJ6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Rfx7F8VPJ6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Rfx7F8VPJ6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Rfx7F8VPJ6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Rfx7F8VPJ6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Rfx7F8VPJ6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Rfx7F8VPJ6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Rfx7F8VPJ6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Rfx7F8VPJ6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Rfx7F8VPJ6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Rfx7F8VPJ6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Rfx7F8VPJ6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Rfx7F8VPJ6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Rfx7F8VPJ6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Rfx7F8VPJ6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Rfx7F8VPJ6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Rfx7F8VPJ6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Rfx7F8VPJ6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Rfx7F8VPJ6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Rfx7F8VPJ6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Rfx7F8VPJ6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Rfx7F8VPJ6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Rfx7F8VPJ6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Rfx7F8VPJ6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Rfx7F8VPJ6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Rfx7F8VPJ6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Rfx7F8VPJ6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Rfx7F8VPJ6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
Rfx7F8VPJ6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Rfx7F8VPJ6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Rfx7F8VPJ6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Rfx7F8VPJ6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Rfx7F8VPJ6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Rfx7F8VPJ6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Rfx7F8VPJ6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Rfx7F8VPJ6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Rfx7F8VPJ6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Rfx7F8VPJ6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Rfx7F8VPJ6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Rfx7F8VPJ6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Rfx7F8VPJ6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Rfx7F8VPJ6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Rfx7F8VPJ6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Rfx7F8VPJ6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Rfx7F8VPJ6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Rfx7F8VPJ6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Rfx7F8VPJ6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Rfx7F8VPJ6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Rfx7F8VPJ6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Rfx7F8VPJ6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Rfx7F8VPJ6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Rfx7F8VPJ6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Rfx7F8VPJ6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Rfx7F8VPJ6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms