Protein–RNA interactions for Protein: F6TVX7

Gm20671, Predicted gene 20671 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20671F6TVX7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm20671F6TVX7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm20671F6TVX7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm20671F6TVX7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm20671F6TVX7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm20671F6TVX7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm20671F6TVX7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm20671F6TVX7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm20671F6TVX7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm20671F6TVX7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm20671F6TVX7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm20671F6TVX7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm20671F6TVX7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm20671F6TVX7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm20671F6TVX7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm20671F6TVX7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm20671F6TVX7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm20671F6TVX7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm20671F6TVX7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm20671F6TVX7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm20671F6TVX7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm20671F6TVX7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm20671F6TVX7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm20671F6TVX7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm20671F6TVX7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm20671F6TVX7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm20671F6TVX7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm20671F6TVX7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm20671F6TVX7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm20671F6TVX7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm20671F6TVX7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm20671F6TVX7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm20671F6TVX7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm20671F6TVX7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm20671F6TVX7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm20671F6TVX7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm20671F6TVX7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm20671F6TVX7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm20671F6TVX7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm20671F6TVX7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm20671F6TVX7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm20671F6TVX7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm20671F6TVX7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm20671F6TVX7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm20671F6TVX7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm20671F6TVX7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm20671F6TVX7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm20671F6TVX7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm20671F6TVX7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm20671F6TVX7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm20671F6TVX7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm20671F6TVX7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm20671F6TVX7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm20671F6TVX7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm20671F6TVX7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm20671F6TVX7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm20671F6TVX7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm20671F6TVX7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm20671F6TVX7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm20671F6TVX7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm20671F6TVX7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm20671F6TVX7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm20671F6TVX7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm20671F6TVX7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm20671F6TVX7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm20671F6TVX7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm20671F6TVX7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm20671F6TVX7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm20671F6TVX7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm20671F6TVX7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm20671F6TVX7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm20671F6TVX7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm20671F6TVX7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm20671F6TVX7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm20671F6TVX7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm20671F6TVX7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm20671F6TVX7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm20671F6TVX7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm20671F6TVX7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm20671F6TVX7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm20671F6TVX7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm20671F6TVX7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm20671F6TVX7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm20671F6TVX7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm20671F6TVX7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm20671F6TVX7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm20671F6TVX7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm20671F6TVX7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm20671F6TVX7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm20671F6TVX7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm20671F6TVX7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm20671F6TVX7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm20671F6TVX7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm20671F6TVX7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm20671F6TVX7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm20671F6TVX7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm20671F6TVX7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm20671F6TVX7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm20671F6TVX7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm20671F6TVX7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 153.9 ms