Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf212F6TQD1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf212F6TQD1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf212F6TQD1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf212F6TQD1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf212F6TQD1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf212F6TQD1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf212F6TQD1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf212F6TQD1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf212F6TQD1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf212F6TQD1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf212F6TQD1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf212F6TQD1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf212F6TQD1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf212F6TQD1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf212F6TQD1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf212F6TQD1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf212F6TQD1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf212F6TQD1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf212F6TQD1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf212F6TQD1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf212F6TQD1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf212F6TQD1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf212F6TQD1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf212F6TQD1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf212F6TQD1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf212F6TQD1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf212F6TQD1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf212F6TQD1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf212F6TQD1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf212F6TQD1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf212F6TQD1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf212F6TQD1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf212F6TQD1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rnf212F6TQD1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf212F6TQD1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf212F6TQD1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf212F6TQD1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf212F6TQD1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf212F6TQD1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf212F6TQD1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf212F6TQD1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf212F6TQD1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf212F6TQD1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf212F6TQD1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf212F6TQD1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf212F6TQD1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf212F6TQD1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf212F6TQD1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf212F6TQD1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf212F6TQD1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf212F6TQD1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf212F6TQD1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf212F6TQD1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf212F6TQD1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf212F6TQD1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf212F6TQD1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf212F6TQD1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf212F6TQD1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf212F6TQD1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf212F6TQD1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf212F6TQD1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf212F6TQD1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf212F6TQD1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf212F6TQD1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf212F6TQD1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf212F6TQD1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf212F6TQD1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf212F6TQD1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf212F6TQD1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf212F6TQD1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf212F6TQD1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf212F6TQD1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf212F6TQD1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf212F6TQD1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rnf212F6TQD1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rnf212F6TQD1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rnf212F6TQD1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf212F6TQD1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf212F6TQD1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf212F6TQD1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf212F6TQD1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf212F6TQD1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf212F6TQD1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf212F6TQD1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf212F6TQD1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf212F6TQD1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf212F6TQD1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf212F6TQD1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf212F6TQD1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf212F6TQD1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf212F6TQD1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf212F6TQD1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf212F6TQD1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf212F6TQD1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf212F6TQD1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf212F6TQD1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf212F6TQD1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf212F6TQD1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf212F6TQD1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms