Protein–RNA interactions for Protein: F6SG70

Gm28374, Predicted gene 28374 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28374F6SG70 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28374F6SG70 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28374F6SG70 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28374F6SG70 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28374F6SG70 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28374F6SG70 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28374F6SG70 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28374F6SG70 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28374F6SG70 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28374F6SG70 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28374F6SG70 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28374F6SG70 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28374F6SG70 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28374F6SG70 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28374F6SG70 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28374F6SG70 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28374F6SG70 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28374F6SG70 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28374F6SG70 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28374F6SG70 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28374F6SG70 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28374F6SG70 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28374F6SG70 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28374F6SG70 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28374F6SG70 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28374F6SG70 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28374F6SG70 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28374F6SG70 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28374F6SG70 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28374F6SG70 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28374F6SG70 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28374F6SG70 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28374F6SG70 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28374F6SG70 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28374F6SG70 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28374F6SG70 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28374F6SG70 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28374F6SG70 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28374F6SG70 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28374F6SG70 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28374F6SG70 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28374F6SG70 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28374F6SG70 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28374F6SG70 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28374F6SG70 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28374F6SG70 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28374F6SG70 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28374F6SG70 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28374F6SG70 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28374F6SG70 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28374F6SG70 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28374F6SG70 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28374F6SG70 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28374F6SG70 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28374F6SG70 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28374F6SG70 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28374F6SG70 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28374F6SG70 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28374F6SG70 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28374F6SG70 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28374F6SG70 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28374F6SG70 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28374F6SG70 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28374F6SG70 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28374F6SG70 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28374F6SG70 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28374F6SG70 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28374F6SG70 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28374F6SG70 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28374F6SG70 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28374F6SG70 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28374F6SG70 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28374F6SG70 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28374F6SG70 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28374F6SG70 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28374F6SG70 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28374F6SG70 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28374F6SG70 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28374F6SG70 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28374F6SG70 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28374F6SG70 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm28374F6SG70 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28374F6SG70 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28374F6SG70 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28374F6SG70 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28374F6SG70 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28374F6SG70 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28374F6SG70 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28374F6SG70 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28374F6SG70 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28374F6SG70 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28374F6SG70 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28374F6SG70 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28374F6SG70 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28374F6SG70 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28374F6SG70 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28374F6SG70 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28374F6SG70 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28374F6SG70 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28374F6SG70 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms