Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Syngap1F6SEU4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Syngap1F6SEU4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Syngap1F6SEU4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Syngap1F6SEU4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Syngap1F6SEU4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Syngap1F6SEU4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Syngap1F6SEU4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Syngap1F6SEU4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Syngap1F6SEU4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Syngap1F6SEU4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Syngap1F6SEU4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Syngap1F6SEU4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Syngap1F6SEU4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Syngap1F6SEU4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Syngap1F6SEU4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Syngap1F6SEU4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Syngap1F6SEU4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Syngap1F6SEU4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Syngap1F6SEU4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Syngap1F6SEU4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Syngap1F6SEU4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Syngap1F6SEU4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Syngap1F6SEU4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Syngap1F6SEU4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Syngap1F6SEU4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Syngap1F6SEU4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Syngap1F6SEU4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Syngap1F6SEU4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Syngap1F6SEU4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Syngap1F6SEU4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Syngap1F6SEU4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Syngap1F6SEU4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Syngap1F6SEU4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Syngap1F6SEU4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Syngap1F6SEU4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Syngap1F6SEU4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Syngap1F6SEU4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Syngap1F6SEU4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Syngap1F6SEU4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Syngap1F6SEU4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Syngap1F6SEU4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Syngap1F6SEU4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Syngap1F6SEU4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Syngap1F6SEU4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Syngap1F6SEU4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Syngap1F6SEU4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Syngap1F6SEU4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Syngap1F6SEU4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Syngap1F6SEU4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Syngap1F6SEU4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Syngap1F6SEU4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Syngap1F6SEU4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Syngap1F6SEU4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Syngap1F6SEU4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Syngap1F6SEU4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Syngap1F6SEU4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Syngap1F6SEU4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Syngap1F6SEU4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Syngap1F6SEU4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Syngap1F6SEU4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Syngap1F6SEU4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Syngap1F6SEU4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Syngap1F6SEU4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Syngap1F6SEU4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Syngap1F6SEU4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Syngap1F6SEU4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Syngap1F6SEU4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Syngap1F6SEU4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Syngap1F6SEU4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Syngap1F6SEU4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Syngap1F6SEU4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Syngap1F6SEU4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Syngap1F6SEU4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Syngap1F6SEU4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Syngap1F6SEU4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Syngap1F6SEU4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Syngap1F6SEU4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Syngap1F6SEU4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Syngap1F6SEU4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Syngap1F6SEU4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Syngap1F6SEU4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Syngap1F6SEU4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Syngap1F6SEU4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Syngap1F6SEU4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Syngap1F6SEU4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Syngap1F6SEU4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Syngap1F6SEU4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Syngap1F6SEU4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Syngap1F6SEU4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Syngap1F6SEU4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Syngap1F6SEU4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Syngap1F6SEU4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Syngap1F6SEU4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Syngap1F6SEU4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Syngap1F6SEU4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Syngap1F6SEU4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Syngap1F6SEU4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Syngap1F6SEU4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Syngap1F6SEU4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms