Protein–RNA interactions for Protein: F2YMG0

Prss56, Serine protease 56, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss56F2YMG0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prss56F2YMG0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prss56F2YMG0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prss56F2YMG0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prss56F2YMG0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prss56F2YMG0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Prss56F2YMG0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prss56F2YMG0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prss56F2YMG0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prss56F2YMG0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prss56F2YMG0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prss56F2YMG0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prss56F2YMG0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prss56F2YMG0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prss56F2YMG0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prss56F2YMG0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prss56F2YMG0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prss56F2YMG0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prss56F2YMG0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prss56F2YMG0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prss56F2YMG0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prss56F2YMG0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Prss56F2YMG0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prss56F2YMG0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prss56F2YMG0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prss56F2YMG0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prss56F2YMG0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prss56F2YMG0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prss56F2YMG0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prss56F2YMG0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Prss56F2YMG0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Prss56F2YMG0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Prss56F2YMG0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prss56F2YMG0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prss56F2YMG0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prss56F2YMG0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prss56F2YMG0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prss56F2YMG0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prss56F2YMG0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prss56F2YMG0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prss56F2YMG0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prss56F2YMG0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prss56F2YMG0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prss56F2YMG0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prss56F2YMG0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prss56F2YMG0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prss56F2YMG0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prss56F2YMG0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prss56F2YMG0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prss56F2YMG0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prss56F2YMG0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prss56F2YMG0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prss56F2YMG0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prss56F2YMG0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prss56F2YMG0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prss56F2YMG0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prss56F2YMG0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prss56F2YMG0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prss56F2YMG0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prss56F2YMG0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prss56F2YMG0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prss56F2YMG0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prss56F2YMG0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prss56F2YMG0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prss56F2YMG0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prss56F2YMG0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prss56F2YMG0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Prss56F2YMG0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Prss56F2YMG0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Prss56F2YMG0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Prss56F2YMG0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Prss56F2YMG0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Prss56F2YMG0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Prss56F2YMG0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Prss56F2YMG0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Prss56F2YMG0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Prss56F2YMG0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Prss56F2YMG0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Prss56F2YMG0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Prss56F2YMG0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prss56F2YMG0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prss56F2YMG0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prss56F2YMG0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prss56F2YMG0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prss56F2YMG0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prss56F2YMG0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prss56F2YMG0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prss56F2YMG0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Prss56F2YMG0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Prss56F2YMG0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Prss56F2YMG0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Prss56F2YMG0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Prss56F2YMG0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Prss56F2YMG0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Prss56F2YMG0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prss56F2YMG0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prss56F2YMG0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prss56F2YMG0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prss56F2YMG0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prss56F2YMG0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms