Protein–RNA interactions for Protein: E9QAF4

Phldb3, Pleckstrin homology-like domain, family B, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phldb3E9QAF4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Phldb3E9QAF4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Phldb3E9QAF4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Phldb3E9QAF4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Phldb3E9QAF4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Phldb3E9QAF4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Phldb3E9QAF4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Phldb3E9QAF4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Phldb3E9QAF4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Phldb3E9QAF4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Phldb3E9QAF4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Phldb3E9QAF4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Phldb3E9QAF4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Phldb3E9QAF4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Phldb3E9QAF4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Phldb3E9QAF4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Phldb3E9QAF4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Phldb3E9QAF4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Phldb3E9QAF4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Phldb3E9QAF4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Phldb3E9QAF4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Phldb3E9QAF4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Phldb3E9QAF4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Phldb3E9QAF4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Phldb3E9QAF4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Phldb3E9QAF4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Phldb3E9QAF4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Phldb3E9QAF4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Phldb3E9QAF4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Phldb3E9QAF4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Phldb3E9QAF4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Phldb3E9QAF4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Phldb3E9QAF4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Phldb3E9QAF4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Phldb3E9QAF4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Phldb3E9QAF4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Phldb3E9QAF4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Phldb3E9QAF4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Phldb3E9QAF4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Phldb3E9QAF4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Phldb3E9QAF4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Phldb3E9QAF4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Phldb3E9QAF4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Phldb3E9QAF4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Phldb3E9QAF4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Phldb3E9QAF4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Phldb3E9QAF4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Phldb3E9QAF4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Phldb3E9QAF4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Phldb3E9QAF4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Phldb3E9QAF4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Phldb3E9QAF4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Phldb3E9QAF4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Phldb3E9QAF4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Phldb3E9QAF4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Phldb3E9QAF4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Phldb3E9QAF4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Phldb3E9QAF4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Phldb3E9QAF4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Phldb3E9QAF4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Phldb3E9QAF4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Phldb3E9QAF4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Phldb3E9QAF4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Phldb3E9QAF4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Phldb3E9QAF4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Phldb3E9QAF4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Phldb3E9QAF4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Phldb3E9QAF4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Phldb3E9QAF4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Phldb3E9QAF4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Phldb3E9QAF4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Phldb3E9QAF4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Phldb3E9QAF4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Phldb3E9QAF4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Phldb3E9QAF4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Phldb3E9QAF4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Phldb3E9QAF4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Phldb3E9QAF4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Phldb3E9QAF4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Phldb3E9QAF4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Phldb3E9QAF4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Phldb3E9QAF4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Phldb3E9QAF4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Phldb3E9QAF4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Phldb3E9QAF4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Phldb3E9QAF4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Phldb3E9QAF4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Phldb3E9QAF4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Phldb3E9QAF4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Phldb3E9QAF4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Phldb3E9QAF4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Phldb3E9QAF4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Phldb3E9QAF4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Phldb3E9QAF4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Phldb3E9QAF4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Phldb3E9QAF4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Phldb3E9QAF4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Phldb3E9QAF4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Phldb3E9QAF4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Phldb3E9QAF4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms