Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc7bE9Q9Y3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc7bE9Q9Y3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc7bE9Q9Y3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc7bE9Q9Y3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc7bE9Q9Y3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc7bE9Q9Y3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc7bE9Q9Y3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc7bE9Q9Y3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc7bE9Q9Y3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc7bE9Q9Y3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc7bE9Q9Y3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc7bE9Q9Y3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc7bE9Q9Y3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc7bE9Q9Y3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc7bE9Q9Y3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc7bE9Q9Y3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc7bE9Q9Y3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc7bE9Q9Y3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc7bE9Q9Y3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc7bE9Q9Y3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc7bE9Q9Y3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc7bE9Q9Y3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc7bE9Q9Y3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc7bE9Q9Y3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc7bE9Q9Y3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc7bE9Q9Y3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc7bE9Q9Y3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc7bE9Q9Y3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc7bE9Q9Y3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc7bE9Q9Y3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc7bE9Q9Y3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc7bE9Q9Y3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc7bE9Q9Y3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc7bE9Q9Y3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc7bE9Q9Y3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc7bE9Q9Y3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc7bE9Q9Y3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc7bE9Q9Y3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc7bE9Q9Y3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc7bE9Q9Y3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc7bE9Q9Y3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc7bE9Q9Y3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc7bE9Q9Y3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc7bE9Q9Y3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ccdc7bE9Q9Y3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc7bE9Q9Y3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc7bE9Q9Y3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc7bE9Q9Y3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc7bE9Q9Y3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc7bE9Q9Y3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc7bE9Q9Y3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc7bE9Q9Y3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc7bE9Q9Y3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc7bE9Q9Y3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc7bE9Q9Y3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc7bE9Q9Y3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc7bE9Q9Y3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc7bE9Q9Y3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc7bE9Q9Y3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc7bE9Q9Y3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc7bE9Q9Y3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc7bE9Q9Y3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc7bE9Q9Y3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc7bE9Q9Y3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc7bE9Q9Y3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc7bE9Q9Y3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc7bE9Q9Y3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc7bE9Q9Y3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc7bE9Q9Y3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc7bE9Q9Y3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc7bE9Q9Y3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc7bE9Q9Y3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc7bE9Q9Y3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms