Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q6

Cdh18, Cadherin 18, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh18E9Q9Q6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdh18E9Q9Q6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cdh18E9Q9Q6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cdh18E9Q9Q6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdh18E9Q9Q6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdh18E9Q9Q6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdh18E9Q9Q6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdh18E9Q9Q6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdh18E9Q9Q6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdh18E9Q9Q6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdh18E9Q9Q6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdh18E9Q9Q6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdh18E9Q9Q6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdh18E9Q9Q6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdh18E9Q9Q6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdh18E9Q9Q6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdh18E9Q9Q6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdh18E9Q9Q6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdh18E9Q9Q6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdh18E9Q9Q6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdh18E9Q9Q6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdh18E9Q9Q6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdh18E9Q9Q6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdh18E9Q9Q6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdh18E9Q9Q6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdh18E9Q9Q6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdh18E9Q9Q6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdh18E9Q9Q6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdh18E9Q9Q6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdh18E9Q9Q6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdh18E9Q9Q6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdh18E9Q9Q6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdh18E9Q9Q6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdh18E9Q9Q6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdh18E9Q9Q6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdh18E9Q9Q6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdh18E9Q9Q6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdh18E9Q9Q6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdh18E9Q9Q6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdh18E9Q9Q6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdh18E9Q9Q6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdh18E9Q9Q6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdh18E9Q9Q6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdh18E9Q9Q6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdh18E9Q9Q6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdh18E9Q9Q6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdh18E9Q9Q6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdh18E9Q9Q6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdh18E9Q9Q6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cdh18E9Q9Q6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdh18E9Q9Q6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdh18E9Q9Q6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdh18E9Q9Q6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdh18E9Q9Q6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdh18E9Q9Q6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdh18E9Q9Q6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdh18E9Q9Q6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdh18E9Q9Q6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdh18E9Q9Q6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdh18E9Q9Q6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdh18E9Q9Q6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdh18E9Q9Q6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdh18E9Q9Q6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdh18E9Q9Q6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdh18E9Q9Q6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdh18E9Q9Q6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdh18E9Q9Q6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdh18E9Q9Q6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdh18E9Q9Q6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdh18E9Q9Q6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdh18E9Q9Q6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdh18E9Q9Q6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdh18E9Q9Q6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdh18E9Q9Q6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdh18E9Q9Q6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdh18E9Q9Q6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdh18E9Q9Q6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdh18E9Q9Q6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdh18E9Q9Q6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdh18E9Q9Q6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdh18E9Q9Q6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdh18E9Q9Q6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdh18E9Q9Q6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdh18E9Q9Q6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdh18E9Q9Q6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdh18E9Q9Q6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdh18E9Q9Q6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdh18E9Q9Q6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdh18E9Q9Q6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdh18E9Q9Q6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdh18E9Q9Q6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdh18E9Q9Q6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdh18E9Q9Q6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdh18E9Q9Q6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdh18E9Q9Q6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdh18E9Q9Q6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdh18E9Q9Q6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdh18E9Q9Q6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdh18E9Q9Q6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdh18E9Q9Q6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.2 ms