Protein–RNA interactions for Protein: E9Q422

A530032D15Rik, RIKEN cDNA A530032D15Rik gene, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A530032D15RikE9Q422 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A530032D15RikE9Q422 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A530032D15RikE9Q422 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
A530032D15RikE9Q422 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A530032D15RikE9Q422 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
A530032D15RikE9Q422 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
A530032D15RikE9Q422 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A530032D15RikE9Q422 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
A530032D15RikE9Q422 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
A530032D15RikE9Q422 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A530032D15RikE9Q422 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A530032D15RikE9Q422 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
A530032D15RikE9Q422 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
A530032D15RikE9Q422 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
A530032D15RikE9Q422 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
A530032D15RikE9Q422 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
A530032D15RikE9Q422 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
A530032D15RikE9Q422 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A530032D15RikE9Q422 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
A530032D15RikE9Q422 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
A530032D15RikE9Q422 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A530032D15RikE9Q422 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A530032D15RikE9Q422 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A530032D15RikE9Q422 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A530032D15RikE9Q422 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A530032D15RikE9Q422 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
A530032D15RikE9Q422 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
A530032D15RikE9Q422 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A530032D15RikE9Q422 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
A530032D15RikE9Q422 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A530032D15RikE9Q422 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
A530032D15RikE9Q422 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
A530032D15RikE9Q422 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
A530032D15RikE9Q422 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A530032D15RikE9Q422 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A530032D15RikE9Q422 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A530032D15RikE9Q422 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
A530032D15RikE9Q422 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A530032D15RikE9Q422 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A530032D15RikE9Q422 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A530032D15RikE9Q422 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A530032D15RikE9Q422 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A530032D15RikE9Q422 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A530032D15RikE9Q422 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A530032D15RikE9Q422 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A530032D15RikE9Q422 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
A530032D15RikE9Q422 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A530032D15RikE9Q422 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A530032D15RikE9Q422 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A530032D15RikE9Q422 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A530032D15RikE9Q422 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A530032D15RikE9Q422 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A530032D15RikE9Q422 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A530032D15RikE9Q422 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A530032D15RikE9Q422 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A530032D15RikE9Q422 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A530032D15RikE9Q422 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A530032D15RikE9Q422 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A530032D15RikE9Q422 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A530032D15RikE9Q422 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A530032D15RikE9Q422 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A530032D15RikE9Q422 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A530032D15RikE9Q422 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A530032D15RikE9Q422 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A530032D15RikE9Q422 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A530032D15RikE9Q422 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A530032D15RikE9Q422 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A530032D15RikE9Q422 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A530032D15RikE9Q422 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A530032D15RikE9Q422 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A530032D15RikE9Q422 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A530032D15RikE9Q422 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A530032D15RikE9Q422 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A530032D15RikE9Q422 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A530032D15RikE9Q422 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A530032D15RikE9Q422 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A530032D15RikE9Q422 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A530032D15RikE9Q422 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
A530032D15RikE9Q422 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A530032D15RikE9Q422 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A530032D15RikE9Q422 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A530032D15RikE9Q422 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A530032D15RikE9Q422 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A530032D15RikE9Q422 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A530032D15RikE9Q422 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A530032D15RikE9Q422 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
A530032D15RikE9Q422 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A530032D15RikE9Q422 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A530032D15RikE9Q422 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A530032D15RikE9Q422 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A530032D15RikE9Q422 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A530032D15RikE9Q422 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A530032D15RikE9Q422 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A530032D15RikE9Q422 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A530032D15RikE9Q422 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A530032D15RikE9Q422 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A530032D15RikE9Q422 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A530032D15RikE9Q422 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A530032D15RikE9Q422 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A530032D15RikE9Q422 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms