Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Tarbp1E9Q368 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
Tarbp1E9Q368 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Tarbp1E9Q368 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Tarbp1E9Q368 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Tarbp1E9Q368 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Tarbp1E9Q368 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Tarbp1E9Q368 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Tarbp1E9Q368 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Tarbp1E9Q368 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Tarbp1E9Q368 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
Tarbp1E9Q368 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Tarbp1E9Q368 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Tarbp1E9Q368 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Tarbp1E9Q368 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Tarbp1E9Q368 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Tarbp1E9Q368 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Tarbp1E9Q368 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Tarbp1E9Q368 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Tarbp1E9Q368 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Tarbp1E9Q368 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Tarbp1E9Q368 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Tarbp1E9Q368 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Tarbp1E9Q368 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Tarbp1E9Q368 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Tarbp1E9Q368 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Tarbp1E9Q368 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Tarbp1E9Q368 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Tarbp1E9Q368 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Tarbp1E9Q368 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
Tarbp1E9Q368 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Tarbp1E9Q368 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Tarbp1E9Q368 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Tarbp1E9Q368 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Tarbp1E9Q368 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Tarbp1E9Q368 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Tarbp1E9Q368 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Tarbp1E9Q368 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Tarbp1E9Q368 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Tarbp1E9Q368 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Tarbp1E9Q368 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Tarbp1E9Q368 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Tarbp1E9Q368 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Tarbp1E9Q368 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
Tarbp1E9Q368 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Tarbp1E9Q368 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Tarbp1E9Q368 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Tarbp1E9Q368 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Tarbp1E9Q368 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Tarbp1E9Q368 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Tarbp1E9Q368 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Tarbp1E9Q368 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Tarbp1E9Q368 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Tarbp1E9Q368 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Tarbp1E9Q368 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Tarbp1E9Q368 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Tarbp1E9Q368 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Tarbp1E9Q368 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Tarbp1E9Q368 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
Tarbp1E9Q368 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Tarbp1E9Q368 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Tarbp1E9Q368 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Tarbp1E9Q368 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Tarbp1E9Q368 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Tarbp1E9Q368 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Tarbp1E9Q368 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Tarbp1E9Q368 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Tarbp1E9Q368 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Tarbp1E9Q368 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Tarbp1E9Q368 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Tarbp1E9Q368 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Tarbp1E9Q368 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Tarbp1E9Q368 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Tarbp1E9Q368 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Tarbp1E9Q368 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Tarbp1E9Q368 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Tarbp1E9Q368 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Tarbp1E9Q368 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Tarbp1E9Q368 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Tarbp1E9Q368 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Tarbp1E9Q368 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Tarbp1E9Q368 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Tarbp1E9Q368 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Tarbp1E9Q368 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Tarbp1E9Q368 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Tarbp1E9Q368 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Tarbp1E9Q368 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Tarbp1E9Q368 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Tarbp1E9Q368 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Tarbp1E9Q368 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Tarbp1E9Q368 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Tarbp1E9Q368 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Tarbp1E9Q368 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Tarbp1E9Q368 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Tarbp1E9Q368 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Tarbp1E9Q368 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Tarbp1E9Q368 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Tarbp1E9Q368 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Tarbp1E9Q368 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Tarbp1E9Q368 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms