Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrp3E9Q1T6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrp3E9Q1T6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrp3E9Q1T6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lrp3E9Q1T6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lrp3E9Q1T6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrp3E9Q1T6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrp3E9Q1T6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrp3E9Q1T6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrp3E9Q1T6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrp3E9Q1T6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrp3E9Q1T6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrp3E9Q1T6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrp3E9Q1T6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrp3E9Q1T6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrp3E9Q1T6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrp3E9Q1T6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrp3E9Q1T6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrp3E9Q1T6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrp3E9Q1T6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrp3E9Q1T6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrp3E9Q1T6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrp3E9Q1T6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrp3E9Q1T6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrp3E9Q1T6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrp3E9Q1T6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrp3E9Q1T6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrp3E9Q1T6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrp3E9Q1T6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrp3E9Q1T6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrp3E9Q1T6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrp3E9Q1T6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrp3E9Q1T6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrp3E9Q1T6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrp3E9Q1T6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrp3E9Q1T6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrp3E9Q1T6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrp3E9Q1T6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrp3E9Q1T6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrp3E9Q1T6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrp3E9Q1T6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrp3E9Q1T6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrp3E9Q1T6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrp3E9Q1T6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrp3E9Q1T6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrp3E9Q1T6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrp3E9Q1T6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrp3E9Q1T6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrp3E9Q1T6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrp3E9Q1T6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrp3E9Q1T6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrp3E9Q1T6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lrp3E9Q1T6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrp3E9Q1T6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrp3E9Q1T6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrp3E9Q1T6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrp3E9Q1T6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrp3E9Q1T6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrp3E9Q1T6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrp3E9Q1T6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrp3E9Q1T6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrp3E9Q1T6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrp3E9Q1T6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrp3E9Q1T6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrp3E9Q1T6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrp3E9Q1T6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrp3E9Q1T6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrp3E9Q1T6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrp3E9Q1T6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrp3E9Q1T6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrp3E9Q1T6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrp3E9Q1T6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrp3E9Q1T6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lrp3E9Q1T6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lrp3E9Q1T6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrp3E9Q1T6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrp3E9Q1T6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrp3E9Q1T6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrp3E9Q1T6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrp3E9Q1T6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrp3E9Q1T6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrp3E9Q1T6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrp3E9Q1T6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrp3E9Q1T6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrp3E9Q1T6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrp3E9Q1T6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrp3E9Q1T6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrp3E9Q1T6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrp3E9Q1T6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrp3E9Q1T6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrp3E9Q1T6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrp3E9Q1T6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrp3E9Q1T6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrp3E9Q1T6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrp3E9Q1T6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrp3E9Q1T6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrp3E9Q1T6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrp3E9Q1T6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrp3E9Q1T6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrp3E9Q1T6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.5 ms