Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0R1

Gm8159, Predicted gene 8159, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8159E9Q0R1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm8159E9Q0R1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm8159E9Q0R1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm8159E9Q0R1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm8159E9Q0R1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm8159E9Q0R1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm8159E9Q0R1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm8159E9Q0R1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm8159E9Q0R1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm8159E9Q0R1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm8159E9Q0R1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm8159E9Q0R1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm8159E9Q0R1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm8159E9Q0R1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm8159E9Q0R1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm8159E9Q0R1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm8159E9Q0R1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm8159E9Q0R1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm8159E9Q0R1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm8159E9Q0R1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm8159E9Q0R1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm8159E9Q0R1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm8159E9Q0R1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8159E9Q0R1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8159E9Q0R1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8159E9Q0R1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8159E9Q0R1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8159E9Q0R1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8159E9Q0R1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8159E9Q0R1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8159E9Q0R1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8159E9Q0R1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8159E9Q0R1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm8159E9Q0R1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm8159E9Q0R1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm8159E9Q0R1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm8159E9Q0R1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm8159E9Q0R1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8159E9Q0R1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8159E9Q0R1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8159E9Q0R1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8159E9Q0R1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8159E9Q0R1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8159E9Q0R1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8159E9Q0R1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8159E9Q0R1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8159E9Q0R1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8159E9Q0R1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8159E9Q0R1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8159E9Q0R1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8159E9Q0R1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm8159E9Q0R1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm8159E9Q0R1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm8159E9Q0R1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm8159E9Q0R1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm8159E9Q0R1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm8159E9Q0R1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm8159E9Q0R1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm8159E9Q0R1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm8159E9Q0R1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm8159E9Q0R1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm8159E9Q0R1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gm8159E9Q0R1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm8159E9Q0R1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm8159E9Q0R1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm8159E9Q0R1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm8159E9Q0R1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8159E9Q0R1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8159E9Q0R1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8159E9Q0R1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm8159E9Q0R1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm8159E9Q0R1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm8159E9Q0R1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8159E9Q0R1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8159E9Q0R1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8159E9Q0R1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8159E9Q0R1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8159E9Q0R1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm8159E9Q0R1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm8159E9Q0R1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm8159E9Q0R1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8159E9Q0R1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8159E9Q0R1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8159E9Q0R1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8159E9Q0R1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8159E9Q0R1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8159E9Q0R1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm8159E9Q0R1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm8159E9Q0R1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm8159E9Q0R1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm8159E9Q0R1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm8159E9Q0R1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm8159E9Q0R1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm8159E9Q0R1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm8159E9Q0R1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm8159E9Q0R1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm8159E9Q0R1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm8159E9Q0R1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm8159E9Q0R1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm8159E9Q0R1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms