Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdr1E9Q0B4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdr1E9Q0B4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdr1E9Q0B4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdr1E9Q0B4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdr1E9Q0B4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdr1E9Q0B4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdr1E9Q0B4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdr1E9Q0B4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdr1E9Q0B4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdr1E9Q0B4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdr1E9Q0B4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdr1E9Q0B4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdr1E9Q0B4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdr1E9Q0B4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdr1E9Q0B4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdr1E9Q0B4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdr1E9Q0B4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdr1E9Q0B4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdr1E9Q0B4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdr1E9Q0B4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdr1E9Q0B4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdr1E9Q0B4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdr1E9Q0B4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdr1E9Q0B4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdr1E9Q0B4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdr1E9Q0B4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdr1E9Q0B4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdr1E9Q0B4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdr1E9Q0B4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdr1E9Q0B4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdr1E9Q0B4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdr1E9Q0B4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdr1E9Q0B4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdr1E9Q0B4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdr1E9Q0B4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdr1E9Q0B4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdr1E9Q0B4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cdr1E9Q0B4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdr1E9Q0B4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdr1E9Q0B4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdr1E9Q0B4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdr1E9Q0B4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdr1E9Q0B4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdr1E9Q0B4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdr1E9Q0B4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdr1E9Q0B4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdr1E9Q0B4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdr1E9Q0B4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdr1E9Q0B4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdr1E9Q0B4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdr1E9Q0B4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdr1E9Q0B4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdr1E9Q0B4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdr1E9Q0B4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdr1E9Q0B4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdr1E9Q0B4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdr1E9Q0B4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdr1E9Q0B4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdr1E9Q0B4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdr1E9Q0B4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdr1E9Q0B4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdr1E9Q0B4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdr1E9Q0B4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdr1E9Q0B4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdr1E9Q0B4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdr1E9Q0B4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdr1E9Q0B4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdr1E9Q0B4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdr1E9Q0B4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdr1E9Q0B4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdr1E9Q0B4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdr1E9Q0B4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdr1E9Q0B4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdr1E9Q0B4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdr1E9Q0B4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdr1E9Q0B4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdr1E9Q0B4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdr1E9Q0B4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdr1E9Q0B4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdr1E9Q0B4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdr1E9Q0B4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdr1E9Q0B4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdr1E9Q0B4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdr1E9Q0B4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdr1E9Q0B4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdr1E9Q0B4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdr1E9Q0B4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdr1E9Q0B4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdr1E9Q0B4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdr1E9Q0B4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdr1E9Q0B4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdr1E9Q0B4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdr1E9Q0B4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdr1E9Q0B4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdr1E9Q0B4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdr1E9Q0B4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdr1E9Q0B4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdr1E9Q0B4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdr1E9Q0B4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms