Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ36

Pkhd1, Polycystic kidney and hepatic disease 1, mousemouse

Predictions only

Length 4,059 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkhd1E9PZ36 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkhd1E9PZ36 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkhd1E9PZ36 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkhd1E9PZ36 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkhd1E9PZ36 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkhd1E9PZ36 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkhd1E9PZ36 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkhd1E9PZ36 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkhd1E9PZ36 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkhd1E9PZ36 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkhd1E9PZ36 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkhd1E9PZ36 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkhd1E9PZ36 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkhd1E9PZ36 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkhd1E9PZ36 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkhd1E9PZ36 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkhd1E9PZ36 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkhd1E9PZ36 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkhd1E9PZ36 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkhd1E9PZ36 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkhd1E9PZ36 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkhd1E9PZ36 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkhd1E9PZ36 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkhd1E9PZ36 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkhd1E9PZ36 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkhd1E9PZ36 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkhd1E9PZ36 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkhd1E9PZ36 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkhd1E9PZ36 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pkhd1E9PZ36 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkhd1E9PZ36 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkhd1E9PZ36 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkhd1E9PZ36 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkhd1E9PZ36 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkhd1E9PZ36 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkhd1E9PZ36 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkhd1E9PZ36 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkhd1E9PZ36 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkhd1E9PZ36 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkhd1E9PZ36 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkhd1E9PZ36 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkhd1E9PZ36 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkhd1E9PZ36 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkhd1E9PZ36 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkhd1E9PZ36 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkhd1E9PZ36 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkhd1E9PZ36 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkhd1E9PZ36 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkhd1E9PZ36 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkhd1E9PZ36 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkhd1E9PZ36 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkhd1E9PZ36 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkhd1E9PZ36 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkhd1E9PZ36 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkhd1E9PZ36 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkhd1E9PZ36 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkhd1E9PZ36 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkhd1E9PZ36 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkhd1E9PZ36 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkhd1E9PZ36 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkhd1E9PZ36 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkhd1E9PZ36 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkhd1E9PZ36 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkhd1E9PZ36 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkhd1E9PZ36 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkhd1E9PZ36 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkhd1E9PZ36 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkhd1E9PZ36 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkhd1E9PZ36 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkhd1E9PZ36 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkhd1E9PZ36 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkhd1E9PZ36 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkhd1E9PZ36 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkhd1E9PZ36 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkhd1E9PZ36 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkhd1E9PZ36 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkhd1E9PZ36 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkhd1E9PZ36 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkhd1E9PZ36 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkhd1E9PZ36 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkhd1E9PZ36 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkhd1E9PZ36 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkhd1E9PZ36 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkhd1E9PZ36 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkhd1E9PZ36 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkhd1E9PZ36 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkhd1E9PZ36 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkhd1E9PZ36 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkhd1E9PZ36 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkhd1E9PZ36 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkhd1E9PZ36 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkhd1E9PZ36 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkhd1E9PZ36 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkhd1E9PZ36 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkhd1E9PZ36 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkhd1E9PZ36 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkhd1E9PZ36 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkhd1E9PZ36 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkhd1E9PZ36 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkhd1E9PZ36 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms