Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3298E9PW80 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3298E9PW80 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3298E9PW80 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3298E9PW80 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3298E9PW80 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3298E9PW80 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3298E9PW80 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3298E9PW80 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3298E9PW80 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3298E9PW80 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3298E9PW80 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3298E9PW80 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3298E9PW80 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3298E9PW80 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3298E9PW80 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3298E9PW80 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3298E9PW80 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3298E9PW80 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3298E9PW80 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3298E9PW80 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3298E9PW80 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3298E9PW80 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3298E9PW80 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3298E9PW80 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3298E9PW80 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3298E9PW80 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3298E9PW80 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3298E9PW80 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3298E9PW80 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3298E9PW80 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3298E9PW80 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3298E9PW80 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3298E9PW80 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3298E9PW80 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3298E9PW80 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3298E9PW80 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3298E9PW80 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3298E9PW80 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3298E9PW80 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3298E9PW80 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3298E9PW80 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3298E9PW80 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3298E9PW80 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3298E9PW80 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3298E9PW80 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3298E9PW80 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3298E9PW80 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3298E9PW80 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3298E9PW80 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3298E9PW80 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3298E9PW80 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3298E9PW80 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3298E9PW80 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3298E9PW80 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3298E9PW80 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3298E9PW80 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3298E9PW80 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3298E9PW80 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3298E9PW80 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3298E9PW80 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3298E9PW80 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3298E9PW80 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3298E9PW80 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3298E9PW80 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3298E9PW80 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3298E9PW80 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3298E9PW80 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gm3298E9PW80 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3298E9PW80 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3298E9PW80 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3298E9PW80 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3298E9PW80 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3298E9PW80 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3298E9PW80 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3298E9PW80 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3298E9PW80 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3298E9PW80 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3298E9PW80 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3298E9PW80 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3298E9PW80 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3298E9PW80 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3298E9PW80 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3298E9PW80 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3298E9PW80 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3298E9PW80 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3298E9PW80 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3298E9PW80 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3298E9PW80 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3298E9PW80 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3298E9PW80 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3298E9PW80 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3298E9PW80 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3298E9PW80 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3298E9PW80 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3298E9PW80 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3298E9PW80 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3298E9PW80 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3298E9PW80 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3298E9PW80 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
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