Protein–RNA interactions for Protein: E9PVJ0

Gm2956, Predicted gene 2956, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2956E9PVJ0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm2956E9PVJ0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm2956E9PVJ0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm2956E9PVJ0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm2956E9PVJ0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm2956E9PVJ0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm2956E9PVJ0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm2956E9PVJ0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm2956E9PVJ0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm2956E9PVJ0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm2956E9PVJ0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm2956E9PVJ0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm2956E9PVJ0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm2956E9PVJ0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm2956E9PVJ0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm2956E9PVJ0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm2956E9PVJ0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm2956E9PVJ0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm2956E9PVJ0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm2956E9PVJ0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm2956E9PVJ0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm2956E9PVJ0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm2956E9PVJ0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm2956E9PVJ0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm2956E9PVJ0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm2956E9PVJ0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm2956E9PVJ0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm2956E9PVJ0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm2956E9PVJ0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm2956E9PVJ0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm2956E9PVJ0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm2956E9PVJ0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm2956E9PVJ0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm2956E9PVJ0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm2956E9PVJ0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm2956E9PVJ0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm2956E9PVJ0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm2956E9PVJ0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm2956E9PVJ0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm2956E9PVJ0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm2956E9PVJ0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm2956E9PVJ0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm2956E9PVJ0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm2956E9PVJ0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm2956E9PVJ0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm2956E9PVJ0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm2956E9PVJ0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm2956E9PVJ0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm2956E9PVJ0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm2956E9PVJ0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm2956E9PVJ0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm2956E9PVJ0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm2956E9PVJ0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm2956E9PVJ0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm2956E9PVJ0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm2956E9PVJ0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm2956E9PVJ0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm2956E9PVJ0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm2956E9PVJ0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm2956E9PVJ0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm2956E9PVJ0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm2956E9PVJ0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm2956E9PVJ0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm2956E9PVJ0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm2956E9PVJ0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm2956E9PVJ0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm2956E9PVJ0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm2956E9PVJ0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm2956E9PVJ0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm2956E9PVJ0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm2956E9PVJ0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm2956E9PVJ0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm2956E9PVJ0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm2956E9PVJ0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm2956E9PVJ0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm2956E9PVJ0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm2956E9PVJ0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm2956E9PVJ0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm2956E9PVJ0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm2956E9PVJ0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm2956E9PVJ0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm2956E9PVJ0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm2956E9PVJ0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm2956E9PVJ0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm2956E9PVJ0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm2956E9PVJ0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm2956E9PVJ0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm2956E9PVJ0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm2956E9PVJ0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm2956E9PVJ0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm2956E9PVJ0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm2956E9PVJ0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm2956E9PVJ0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm2956E9PVJ0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm2956E9PVJ0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm2956E9PVJ0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm2956E9PVJ0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm2956E9PVJ0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm2956E9PVJ0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm2956E9PVJ0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms