Protein–RNA interactions for Protein: E9PV26

Prr36, Proline-rich 36, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr36E9PV26 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prr36E9PV26 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prr36E9PV26 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prr36E9PV26 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prr36E9PV26 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prr36E9PV26 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prr36E9PV26 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prr36E9PV26 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prr36E9PV26 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prr36E9PV26 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prr36E9PV26 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prr36E9PV26 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prr36E9PV26 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prr36E9PV26 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prr36E9PV26 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prr36E9PV26 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prr36E9PV26 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prr36E9PV26 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prr36E9PV26 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prr36E9PV26 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prr36E9PV26 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prr36E9PV26 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prr36E9PV26 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Prr36E9PV26 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prr36E9PV26 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Prr36E9PV26 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Prr36E9PV26 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prr36E9PV26 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Prr36E9PV26 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Prr36E9PV26 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prr36E9PV26 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prr36E9PV26 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prr36E9PV26 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prr36E9PV26 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Prr36E9PV26 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Prr36E9PV26 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prr36E9PV26 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prr36E9PV26 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prr36E9PV26 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prr36E9PV26 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prr36E9PV26 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prr36E9PV26 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prr36E9PV26 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prr36E9PV26 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prr36E9PV26 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prr36E9PV26 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prr36E9PV26 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prr36E9PV26 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prr36E9PV26 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prr36E9PV26 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prr36E9PV26 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prr36E9PV26 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prr36E9PV26 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prr36E9PV26 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prr36E9PV26 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prr36E9PV26 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prr36E9PV26 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prr36E9PV26 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prr36E9PV26 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prr36E9PV26 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prr36E9PV26 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prr36E9PV26 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prr36E9PV26 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prr36E9PV26 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prr36E9PV26 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prr36E9PV26 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prr36E9PV26 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prr36E9PV26 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prr36E9PV26 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prr36E9PV26 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prr36E9PV26 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prr36E9PV26 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prr36E9PV26 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Prr36E9PV26 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prr36E9PV26 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prr36E9PV26 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prr36E9PV26 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prr36E9PV26 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prr36E9PV26 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prr36E9PV26 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prr36E9PV26 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prr36E9PV26 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prr36E9PV26 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prr36E9PV26 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prr36E9PV26 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prr36E9PV26 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prr36E9PV26 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Prr36E9PV26 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prr36E9PV26 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prr36E9PV26 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prr36E9PV26 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prr36E9PV26 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Prr36E9PV26 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prr36E9PV26 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prr36E9PV26 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prr36E9PV26 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prr36E9PV26 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prr36E9PV26 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prr36E9PV26 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prr36E9PV26 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms