Protein–RNA interactions for Protein: E9PUQ3

AU019823, Expressed sequence AU019823, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU019823E9PUQ3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
AU019823E9PUQ3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
AU019823E9PUQ3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
AU019823E9PUQ3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
AU019823E9PUQ3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
AU019823E9PUQ3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
AU019823E9PUQ3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
AU019823E9PUQ3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
AU019823E9PUQ3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
AU019823E9PUQ3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
AU019823E9PUQ3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
AU019823E9PUQ3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
AU019823E9PUQ3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
AU019823E9PUQ3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
AU019823E9PUQ3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
AU019823E9PUQ3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
AU019823E9PUQ3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
AU019823E9PUQ3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
AU019823E9PUQ3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
AU019823E9PUQ3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
AU019823E9PUQ3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
AU019823E9PUQ3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
AU019823E9PUQ3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
AU019823E9PUQ3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
AU019823E9PUQ3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
AU019823E9PUQ3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
AU019823E9PUQ3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
AU019823E9PUQ3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
AU019823E9PUQ3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
AU019823E9PUQ3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
AU019823E9PUQ3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
AU019823E9PUQ3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
AU019823E9PUQ3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
AU019823E9PUQ3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
AU019823E9PUQ3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
AU019823E9PUQ3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
AU019823E9PUQ3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
AU019823E9PUQ3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
AU019823E9PUQ3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
AU019823E9PUQ3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
AU019823E9PUQ3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
AU019823E9PUQ3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
AU019823E9PUQ3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
AU019823E9PUQ3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
AU019823E9PUQ3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
AU019823E9PUQ3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
AU019823E9PUQ3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
AU019823E9PUQ3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
AU019823E9PUQ3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
AU019823E9PUQ3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
AU019823E9PUQ3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
AU019823E9PUQ3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
AU019823E9PUQ3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
AU019823E9PUQ3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
AU019823E9PUQ3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
AU019823E9PUQ3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
AU019823E9PUQ3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
AU019823E9PUQ3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
AU019823E9PUQ3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
AU019823E9PUQ3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
AU019823E9PUQ3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
AU019823E9PUQ3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
AU019823E9PUQ3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
AU019823E9PUQ3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
AU019823E9PUQ3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
AU019823E9PUQ3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
AU019823E9PUQ3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
AU019823E9PUQ3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
AU019823E9PUQ3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
AU019823E9PUQ3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
AU019823E9PUQ3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
AU019823E9PUQ3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
AU019823E9PUQ3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
AU019823E9PUQ3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
AU019823E9PUQ3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
AU019823E9PUQ3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
AU019823E9PUQ3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
AU019823E9PUQ3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
AU019823E9PUQ3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
AU019823E9PUQ3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AU019823E9PUQ3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
AU019823E9PUQ3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AU019823E9PUQ3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AU019823E9PUQ3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
AU019823E9PUQ3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
AU019823E9PUQ3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
AU019823E9PUQ3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
AU019823E9PUQ3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AU019823E9PUQ3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
AU019823E9PUQ3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AU019823E9PUQ3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AU019823E9PUQ3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AU019823E9PUQ3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AU019823E9PUQ3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AU019823E9PUQ3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
AU019823E9PUQ3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
AU019823E9PUQ3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
AU019823E9PUQ3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
AU019823E9PUQ3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
AU019823E9PUQ3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms