Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T8

4930407I10Rik, RIKEN cDNA 4930407I10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930407I10RikD3Z5T8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
4930407I10RikD3Z5T8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
4930407I10RikD3Z5T8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
4930407I10RikD3Z5T8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
4930407I10RikD3Z5T8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
4930407I10RikD3Z5T8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
4930407I10RikD3Z5T8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
4930407I10RikD3Z5T8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
4930407I10RikD3Z5T8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
4930407I10RikD3Z5T8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
4930407I10RikD3Z5T8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
4930407I10RikD3Z5T8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
4930407I10RikD3Z5T8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
4930407I10RikD3Z5T8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
4930407I10RikD3Z5T8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
4930407I10RikD3Z5T8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
4930407I10RikD3Z5T8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
4930407I10RikD3Z5T8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
4930407I10RikD3Z5T8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
4930407I10RikD3Z5T8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
4930407I10RikD3Z5T8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
4930407I10RikD3Z5T8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
4930407I10RikD3Z5T8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
4930407I10RikD3Z5T8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
4930407I10RikD3Z5T8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
4930407I10RikD3Z5T8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
4930407I10RikD3Z5T8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
4930407I10RikD3Z5T8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
4930407I10RikD3Z5T8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
4930407I10RikD3Z5T8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
4930407I10RikD3Z5T8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
4930407I10RikD3Z5T8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
4930407I10RikD3Z5T8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
4930407I10RikD3Z5T8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
4930407I10RikD3Z5T8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
4930407I10RikD3Z5T8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
4930407I10RikD3Z5T8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
4930407I10RikD3Z5T8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
4930407I10RikD3Z5T8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
4930407I10RikD3Z5T8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
4930407I10RikD3Z5T8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
4930407I10RikD3Z5T8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
4930407I10RikD3Z5T8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
4930407I10RikD3Z5T8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
4930407I10RikD3Z5T8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
4930407I10RikD3Z5T8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
4930407I10RikD3Z5T8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
4930407I10RikD3Z5T8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
4930407I10RikD3Z5T8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
4930407I10RikD3Z5T8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
4930407I10RikD3Z5T8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
4930407I10RikD3Z5T8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
4930407I10RikD3Z5T8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
4930407I10RikD3Z5T8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
4930407I10RikD3Z5T8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
4930407I10RikD3Z5T8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
4930407I10RikD3Z5T8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
4930407I10RikD3Z5T8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
4930407I10RikD3Z5T8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
4930407I10RikD3Z5T8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
4930407I10RikD3Z5T8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
4930407I10RikD3Z5T8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
4930407I10RikD3Z5T8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
4930407I10RikD3Z5T8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
4930407I10RikD3Z5T8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
4930407I10RikD3Z5T8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
4930407I10RikD3Z5T8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
4930407I10RikD3Z5T8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
4930407I10RikD3Z5T8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
4930407I10RikD3Z5T8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
4930407I10RikD3Z5T8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
4930407I10RikD3Z5T8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
4930407I10RikD3Z5T8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
4930407I10RikD3Z5T8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
4930407I10RikD3Z5T8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
4930407I10RikD3Z5T8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
4930407I10RikD3Z5T8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
4930407I10RikD3Z5T8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
4930407I10RikD3Z5T8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
4930407I10RikD3Z5T8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
4930407I10RikD3Z5T8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
4930407I10RikD3Z5T8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
4930407I10RikD3Z5T8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
4930407I10RikD3Z5T8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
4930407I10RikD3Z5T8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
4930407I10RikD3Z5T8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
4930407I10RikD3Z5T8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
4930407I10RikD3Z5T8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
4930407I10RikD3Z5T8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
4930407I10RikD3Z5T8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
4930407I10RikD3Z5T8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
4930407I10RikD3Z5T8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
4930407I10RikD3Z5T8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
4930407I10RikD3Z5T8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
4930407I10RikD3Z5T8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
4930407I10RikD3Z5T8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
4930407I10RikD3Z5T8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
4930407I10RikD3Z5T8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
4930407I10RikD3Z5T8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
4930407I10RikD3Z5T8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms