Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T1

Ccdc78, Coiled-coil domain-containing protein 78, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc78D3Z5T1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc78D3Z5T1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc78D3Z5T1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc78D3Z5T1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc78D3Z5T1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc78D3Z5T1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc78D3Z5T1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc78D3Z5T1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc78D3Z5T1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc78D3Z5T1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc78D3Z5T1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc78D3Z5T1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc78D3Z5T1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc78D3Z5T1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc78D3Z5T1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc78D3Z5T1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc78D3Z5T1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc78D3Z5T1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc78D3Z5T1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc78D3Z5T1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc78D3Z5T1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc78D3Z5T1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc78D3Z5T1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc78D3Z5T1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc78D3Z5T1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc78D3Z5T1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc78D3Z5T1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc78D3Z5T1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc78D3Z5T1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc78D3Z5T1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc78D3Z5T1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc78D3Z5T1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc78D3Z5T1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc78D3Z5T1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc78D3Z5T1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc78D3Z5T1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc78D3Z5T1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc78D3Z5T1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc78D3Z5T1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc78D3Z5T1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc78D3Z5T1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc78D3Z5T1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc78D3Z5T1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc78D3Z5T1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc78D3Z5T1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc78D3Z5T1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc78D3Z5T1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc78D3Z5T1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc78D3Z5T1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc78D3Z5T1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc78D3Z5T1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc78D3Z5T1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc78D3Z5T1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc78D3Z5T1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc78D3Z5T1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc78D3Z5T1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc78D3Z5T1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc78D3Z5T1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc78D3Z5T1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc78D3Z5T1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc78D3Z5T1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc78D3Z5T1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc78D3Z5T1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc78D3Z5T1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc78D3Z5T1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc78D3Z5T1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc78D3Z5T1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc78D3Z5T1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc78D3Z5T1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc78D3Z5T1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc78D3Z5T1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc78D3Z5T1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc78D3Z5T1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc78D3Z5T1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc78D3Z5T1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc78D3Z5T1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc78D3Z5T1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc78D3Z5T1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc78D3Z5T1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc78D3Z5T1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc78D3Z5T1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc78D3Z5T1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc78D3Z5T1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc78D3Z5T1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc78D3Z5T1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc78D3Z5T1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc78D3Z5T1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc78D3Z5T1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc78D3Z5T1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc78D3Z5T1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc78D3Z5T1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc78D3Z5T1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc78D3Z5T1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc78D3Z5T1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc78D3Z5T1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc78D3Z5T1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc78D3Z5T1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc78D3Z5T1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc78D3Z5T1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc78D3Z5T1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms