Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.3 ms