Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kif28pD3YXS5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kif28pD3YXS5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kif28pD3YXS5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kif28pD3YXS5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kif28pD3YXS5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kif28pD3YXS5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kif28pD3YXS5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kif28pD3YXS5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kif28pD3YXS5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kif28pD3YXS5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Kif28pD3YXS5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kif28pD3YXS5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kif28pD3YXS5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kif28pD3YXS5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kif28pD3YXS5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kif28pD3YXS5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kif28pD3YXS5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kif28pD3YXS5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kif28pD3YXS5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kif28pD3YXS5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kif28pD3YXS5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kif28pD3YXS5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kif28pD3YXS5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kif28pD3YXS5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kif28pD3YXS5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kif28pD3YXS5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kif28pD3YXS5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kif28pD3YXS5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kif28pD3YXS5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kif28pD3YXS5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kif28pD3YXS5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kif28pD3YXS5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kif28pD3YXS5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kif28pD3YXS5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kif28pD3YXS5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kif28pD3YXS5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Kif28pD3YXS5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kif28pD3YXS5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kif28pD3YXS5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kif28pD3YXS5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Kif28pD3YXS5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kif28pD3YXS5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kif28pD3YXS5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kif28pD3YXS5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kif28pD3YXS5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kif28pD3YXS5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kif28pD3YXS5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kif28pD3YXS5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kif28pD3YXS5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kif28pD3YXS5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kif28pD3YXS5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kif28pD3YXS5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kif28pD3YXS5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kif28pD3YXS5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kif28pD3YXS5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kif28pD3YXS5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kif28pD3YXS5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kif28pD3YXS5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kif28pD3YXS5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kif28pD3YXS5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kif28pD3YXS5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kif28pD3YXS5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kif28pD3YXS5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kif28pD3YXS5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kif28pD3YXS5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kif28pD3YXS5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kif28pD3YXS5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kif28pD3YXS5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kif28pD3YXS5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kif28pD3YXS5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kif28pD3YXS5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kif28pD3YXS5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kif28pD3YXS5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kif28pD3YXS5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kif28pD3YXS5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kif28pD3YXS5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Kif28pD3YXS5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Kif28pD3YXS5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kif28pD3YXS5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kif28pD3YXS5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kif28pD3YXS5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kif28pD3YXS5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kif28pD3YXS5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kif28pD3YXS5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kif28pD3YXS5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kif28pD3YXS5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kif28pD3YXS5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kif28pD3YXS5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kif28pD3YXS5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kif28pD3YXS5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kif28pD3YXS5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Kif28pD3YXS5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kif28pD3YXS5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kif28pD3YXS5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kif28pD3YXS5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kif28pD3YXS5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Kif28pD3YXS5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kif28pD3YXS5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kif28pD3YXS5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms