Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ57

Mterf1b, Transcription termination factor 1b, mitochondrial, mousemouse

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1bB9EJ57 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Mterf1bB9EJ57 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Mterf1bB9EJ57 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mterf1bB9EJ57 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mterf1bB9EJ57 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mterf1bB9EJ57 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mterf1bB9EJ57 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mterf1bB9EJ57 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mterf1bB9EJ57 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mterf1bB9EJ57 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mterf1bB9EJ57 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mterf1bB9EJ57 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mterf1bB9EJ57 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mterf1bB9EJ57 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mterf1bB9EJ57 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mterf1bB9EJ57 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mterf1bB9EJ57 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mterf1bB9EJ57 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mterf1bB9EJ57 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mterf1bB9EJ57 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mterf1bB9EJ57 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mterf1bB9EJ57 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mterf1bB9EJ57 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Mterf1bB9EJ57 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mterf1bB9EJ57 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mterf1bB9EJ57 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mterf1bB9EJ57 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mterf1bB9EJ57 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mterf1bB9EJ57 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mterf1bB9EJ57 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mterf1bB9EJ57 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mterf1bB9EJ57 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mterf1bB9EJ57 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mterf1bB9EJ57 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mterf1bB9EJ57 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mterf1bB9EJ57 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mterf1bB9EJ57 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mterf1bB9EJ57 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mterf1bB9EJ57 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mterf1bB9EJ57 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mterf1bB9EJ57 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mterf1bB9EJ57 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mterf1bB9EJ57 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mterf1bB9EJ57 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mterf1bB9EJ57 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mterf1bB9EJ57 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mterf1bB9EJ57 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mterf1bB9EJ57 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mterf1bB9EJ57 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mterf1bB9EJ57 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mterf1bB9EJ57 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mterf1bB9EJ57 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mterf1bB9EJ57 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mterf1bB9EJ57 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mterf1bB9EJ57 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mterf1bB9EJ57 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mterf1bB9EJ57 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mterf1bB9EJ57 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Mterf1bB9EJ57 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Mterf1bB9EJ57 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mterf1bB9EJ57 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mterf1bB9EJ57 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mterf1bB9EJ57 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mterf1bB9EJ57 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mterf1bB9EJ57 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mterf1bB9EJ57 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mterf1bB9EJ57 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mterf1bB9EJ57 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mterf1bB9EJ57 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mterf1bB9EJ57 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mterf1bB9EJ57 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mterf1bB9EJ57 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mterf1bB9EJ57 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mterf1bB9EJ57 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mterf1bB9EJ57 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mterf1bB9EJ57 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mterf1bB9EJ57 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mterf1bB9EJ57 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mterf1bB9EJ57 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mterf1bB9EJ57 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mterf1bB9EJ57 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mterf1bB9EJ57 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mterf1bB9EJ57 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mterf1bB9EJ57 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mterf1bB9EJ57 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mterf1bB9EJ57 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mterf1bB9EJ57 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mterf1bB9EJ57 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Mterf1bB9EJ57 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mterf1bB9EJ57 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mterf1bB9EJ57 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mterf1bB9EJ57 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mterf1bB9EJ57 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Mterf1bB9EJ57 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mterf1bB9EJ57 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mterf1bB9EJ57 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mterf1bB9EJ57 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mterf1bB9EJ57 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Mterf1bB9EJ57 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mterf1bB9EJ57 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms