Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clip3B9EHT4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clip3B9EHT4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Clip3B9EHT4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clip3B9EHT4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clip3B9EHT4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Clip3B9EHT4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clip3B9EHT4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clip3B9EHT4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clip3B9EHT4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clip3B9EHT4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clip3B9EHT4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clip3B9EHT4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clip3B9EHT4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clip3B9EHT4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Clip3B9EHT4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Clip3B9EHT4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Clip3B9EHT4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clip3B9EHT4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clip3B9EHT4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clip3B9EHT4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clip3B9EHT4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clip3B9EHT4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clip3B9EHT4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Clip3B9EHT4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clip3B9EHT4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Clip3B9EHT4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clip3B9EHT4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clip3B9EHT4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Clip3B9EHT4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clip3B9EHT4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clip3B9EHT4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clip3B9EHT4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clip3B9EHT4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clip3B9EHT4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clip3B9EHT4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clip3B9EHT4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clip3B9EHT4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clip3B9EHT4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clip3B9EHT4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clip3B9EHT4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Clip3B9EHT4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clip3B9EHT4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clip3B9EHT4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clip3B9EHT4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clip3B9EHT4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clip3B9EHT4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clip3B9EHT4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clip3B9EHT4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clip3B9EHT4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Clip3B9EHT4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clip3B9EHT4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Clip3B9EHT4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clip3B9EHT4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Clip3B9EHT4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clip3B9EHT4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clip3B9EHT4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clip3B9EHT4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clip3B9EHT4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clip3B9EHT4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clip3B9EHT4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clip3B9EHT4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Clip3B9EHT4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clip3B9EHT4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clip3B9EHT4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clip3B9EHT4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clip3B9EHT4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clip3B9EHT4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clip3B9EHT4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clip3B9EHT4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clip3B9EHT4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clip3B9EHT4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clip3B9EHT4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clip3B9EHT4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clip3B9EHT4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clip3B9EHT4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clip3B9EHT4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clip3B9EHT4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clip3B9EHT4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clip3B9EHT4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Clip3B9EHT4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clip3B9EHT4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clip3B9EHT4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clip3B9EHT4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clip3B9EHT4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clip3B9EHT4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clip3B9EHT4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clip3B9EHT4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clip3B9EHT4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clip3B9EHT4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clip3B9EHT4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Clip3B9EHT4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clip3B9EHT4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clip3B9EHT4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clip3B9EHT4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clip3B9EHT4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clip3B9EHT4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clip3B9EHT4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clip3B9EHT4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clip3B9EHT4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms