Protein–RNA interactions for Protein: B8QI36

Ppfia4, Liprin-alpha 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia4B8QI36 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ppfia4B8QI36 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ppfia4B8QI36 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ppfia4B8QI36 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ppfia4B8QI36 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppfia4B8QI36 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppfia4B8QI36 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppfia4B8QI36 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppfia4B8QI36 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppfia4B8QI36 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppfia4B8QI36 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppfia4B8QI36 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppfia4B8QI36 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppfia4B8QI36 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppfia4B8QI36 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppfia4B8QI36 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppfia4B8QI36 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppfia4B8QI36 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppfia4B8QI36 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppfia4B8QI36 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppfia4B8QI36 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ppfia4B8QI36 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ppfia4B8QI36 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ppfia4B8QI36 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ppfia4B8QI36 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ppfia4B8QI36 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ppfia4B8QI36 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ppfia4B8QI36 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppfia4B8QI36 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppfia4B8QI36 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppfia4B8QI36 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppfia4B8QI36 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppfia4B8QI36 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ppfia4B8QI36 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ppfia4B8QI36 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ppfia4B8QI36 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ppfia4B8QI36 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ppfia4B8QI36 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ppfia4B8QI36 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppfia4B8QI36 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppfia4B8QI36 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppfia4B8QI36 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppfia4B8QI36 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ppfia4B8QI36 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ppfia4B8QI36 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ppfia4B8QI36 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ppfia4B8QI36 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ppfia4B8QI36 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ppfia4B8QI36 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ppfia4B8QI36 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppfia4B8QI36 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppfia4B8QI36 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppfia4B8QI36 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppfia4B8QI36 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppfia4B8QI36 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppfia4B8QI36 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppfia4B8QI36 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppfia4B8QI36 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppfia4B8QI36 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppfia4B8QI36 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppfia4B8QI36 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppfia4B8QI36 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppfia4B8QI36 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppfia4B8QI36 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppfia4B8QI36 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppfia4B8QI36 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ppfia4B8QI36 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ppfia4B8QI36 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ppfia4B8QI36 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ppfia4B8QI36 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ppfia4B8QI36 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ppfia4B8QI36 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppfia4B8QI36 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppfia4B8QI36 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppfia4B8QI36 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppfia4B8QI36 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppfia4B8QI36 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppfia4B8QI36 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppfia4B8QI36 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppfia4B8QI36 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppfia4B8QI36 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppfia4B8QI36 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppfia4B8QI36 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppfia4B8QI36 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppfia4B8QI36 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppfia4B8QI36 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppfia4B8QI36 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppfia4B8QI36 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppfia4B8QI36 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppfia4B8QI36 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppfia4B8QI36 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppfia4B8QI36 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppfia4B8QI36 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppfia4B8QI36 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppfia4B8QI36 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppfia4B8QI36 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppfia4B8QI36 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppfia4B8QI36 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppfia4B8QI36 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppfia4B8QI36 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms