Protein–RNA interactions for Protein: B2RUR8

Otud7b, OTU domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud7bB2RUR8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Otud7bB2RUR8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Otud7bB2RUR8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Otud7bB2RUR8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Otud7bB2RUR8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Otud7bB2RUR8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Otud7bB2RUR8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Otud7bB2RUR8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Otud7bB2RUR8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Otud7bB2RUR8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Otud7bB2RUR8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Otud7bB2RUR8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Otud7bB2RUR8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Otud7bB2RUR8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Otud7bB2RUR8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Otud7bB2RUR8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Otud7bB2RUR8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Otud7bB2RUR8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Otud7bB2RUR8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Otud7bB2RUR8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Otud7bB2RUR8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Otud7bB2RUR8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Otud7bB2RUR8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Otud7bB2RUR8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Otud7bB2RUR8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Otud7bB2RUR8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Otud7bB2RUR8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Otud7bB2RUR8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Otud7bB2RUR8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Otud7bB2RUR8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Otud7bB2RUR8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Otud7bB2RUR8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Otud7bB2RUR8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Otud7bB2RUR8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Otud7bB2RUR8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Otud7bB2RUR8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Otud7bB2RUR8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Otud7bB2RUR8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Otud7bB2RUR8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Otud7bB2RUR8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Otud7bB2RUR8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Otud7bB2RUR8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Otud7bB2RUR8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Otud7bB2RUR8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Otud7bB2RUR8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Otud7bB2RUR8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Otud7bB2RUR8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Otud7bB2RUR8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Otud7bB2RUR8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Otud7bB2RUR8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Otud7bB2RUR8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Otud7bB2RUR8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Otud7bB2RUR8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Otud7bB2RUR8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Otud7bB2RUR8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Otud7bB2RUR8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Otud7bB2RUR8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Otud7bB2RUR8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Otud7bB2RUR8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Otud7bB2RUR8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Otud7bB2RUR8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Otud7bB2RUR8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Otud7bB2RUR8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Otud7bB2RUR8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Otud7bB2RUR8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Otud7bB2RUR8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Otud7bB2RUR8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Otud7bB2RUR8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Otud7bB2RUR8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Otud7bB2RUR8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Otud7bB2RUR8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Otud7bB2RUR8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Otud7bB2RUR8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Otud7bB2RUR8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Otud7bB2RUR8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Otud7bB2RUR8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Otud7bB2RUR8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Otud7bB2RUR8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Otud7bB2RUR8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Otud7bB2RUR8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Otud7bB2RUR8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Otud7bB2RUR8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Otud7bB2RUR8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Otud7bB2RUR8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Otud7bB2RUR8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Otud7bB2RUR8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Otud7bB2RUR8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Otud7bB2RUR8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Otud7bB2RUR8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Otud7bB2RUR8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Otud7bB2RUR8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Otud7bB2RUR8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Otud7bB2RUR8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Otud7bB2RUR8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Otud7bB2RUR8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Otud7bB2RUR8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Otud7bB2RUR8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Otud7bB2RUR8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Otud7bB2RUR8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Otud7bB2RUR8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms