Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
AU015836B2RUM3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AU015836B2RUM3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
AU015836B2RUM3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
AU015836B2RUM3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AU015836B2RUM3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AU015836B2RUM3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AU015836B2RUM3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AU015836B2RUM3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AU015836B2RUM3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AU015836B2RUM3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
AU015836B2RUM3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
AU015836B2RUM3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
AU015836B2RUM3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AU015836B2RUM3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AU015836B2RUM3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AU015836B2RUM3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AU015836B2RUM3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
AU015836B2RUM3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AU015836B2RUM3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AU015836B2RUM3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AU015836B2RUM3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AU015836B2RUM3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AU015836B2RUM3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
AU015836B2RUM3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AU015836B2RUM3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AU015836B2RUM3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
AU015836B2RUM3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
AU015836B2RUM3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
AU015836B2RUM3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
AU015836B2RUM3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
AU015836B2RUM3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
AU015836B2RUM3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
AU015836B2RUM3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
AU015836B2RUM3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
AU015836B2RUM3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
AU015836B2RUM3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
AU015836B2RUM3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
AU015836B2RUM3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
AU015836B2RUM3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
AU015836B2RUM3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
AU015836B2RUM3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
AU015836B2RUM3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
AU015836B2RUM3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AU015836B2RUM3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AU015836B2RUM3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AU015836B2RUM3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AU015836B2RUM3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
AU015836B2RUM3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AU015836B2RUM3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
AU015836B2RUM3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AU015836B2RUM3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AU015836B2RUM3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AU015836B2RUM3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
AU015836B2RUM3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
AU015836B2RUM3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AU015836B2RUM3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AU015836B2RUM3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AU015836B2RUM3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
AU015836B2RUM3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AU015836B2RUM3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AU015836B2RUM3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
AU015836B2RUM3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AU015836B2RUM3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AU015836B2RUM3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AU015836B2RUM3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AU015836B2RUM3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AU015836B2RUM3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
AU015836B2RUM3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
AU015836B2RUM3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
AU015836B2RUM3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
AU015836B2RUM3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
AU015836B2RUM3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
AU015836B2RUM3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
AU015836B2RUM3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
AU015836B2RUM3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
AU015836B2RUM3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
AU015836B2RUM3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AU015836B2RUM3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
AU015836B2RUM3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AU015836B2RUM3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AU015836B2RUM3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AU015836B2RUM3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AU015836B2RUM3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
AU015836B2RUM3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AU015836B2RUM3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AU015836B2RUM3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AU015836B2RUM3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
AU015836B2RUM3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
AU015836B2RUM3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
AU015836B2RUM3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
AU015836B2RUM3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
AU015836B2RUM3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AU015836B2RUM3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AU015836B2RUM3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AU015836B2RUM3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AU015836B2RUM3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AU015836B2RUM3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
AU015836B2RUM3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AU015836B2RUM3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms