Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Otud4B2RRE7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Otud4B2RRE7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Otud4B2RRE7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Otud4B2RRE7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Otud4B2RRE7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Otud4B2RRE7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Otud4B2RRE7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Otud4B2RRE7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Otud4B2RRE7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Otud4B2RRE7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Otud4B2RRE7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Otud4B2RRE7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Otud4B2RRE7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Otud4B2RRE7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Otud4B2RRE7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Otud4B2RRE7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Otud4B2RRE7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Otud4B2RRE7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Otud4B2RRE7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Otud4B2RRE7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Otud4B2RRE7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Otud4B2RRE7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Otud4B2RRE7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Otud4B2RRE7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Otud4B2RRE7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Otud4B2RRE7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Otud4B2RRE7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Otud4B2RRE7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Otud4B2RRE7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Otud4B2RRE7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Otud4B2RRE7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Otud4B2RRE7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Otud4B2RRE7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Otud4B2RRE7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Otud4B2RRE7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Otud4B2RRE7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Otud4B2RRE7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Otud4B2RRE7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Otud4B2RRE7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Otud4B2RRE7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Otud4B2RRE7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Otud4B2RRE7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Otud4B2RRE7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Otud4B2RRE7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Otud4B2RRE7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Otud4B2RRE7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Otud4B2RRE7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Otud4B2RRE7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Otud4B2RRE7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Otud4B2RRE7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Otud4B2RRE7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Otud4B2RRE7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Otud4B2RRE7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Otud4B2RRE7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Otud4B2RRE7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Otud4B2RRE7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Otud4B2RRE7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Otud4B2RRE7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Otud4B2RRE7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Otud4B2RRE7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Otud4B2RRE7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Otud4B2RRE7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Otud4B2RRE7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Otud4B2RRE7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Otud4B2RRE7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Otud4B2RRE7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Otud4B2RRE7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Otud4B2RRE7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Otud4B2RRE7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Otud4B2RRE7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Otud4B2RRE7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Otud4B2RRE7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Otud4B2RRE7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Otud4B2RRE7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Otud4B2RRE7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Otud4B2RRE7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Otud4B2RRE7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Otud4B2RRE7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Otud4B2RRE7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Otud4B2RRE7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Otud4B2RRE7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Otud4B2RRE7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Otud4B2RRE7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Otud4B2RRE7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Otud4B2RRE7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Otud4B2RRE7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Otud4B2RRE7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Otud4B2RRE7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Otud4B2RRE7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Otud4B2RRE7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Otud4B2RRE7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Otud4B2RRE7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Otud4B2RRE7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Otud4B2RRE7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Otud4B2RRE7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Otud4B2RRE7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Otud4B2RRE7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Otud4B2RRE7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Otud4B2RRE7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms