Protein–RNA interactions for Protein: B1AYB6

Mbd5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd5B1AYB6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Mbd5B1AYB6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Mbd5B1AYB6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Mbd5B1AYB6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Mbd5B1AYB6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Mbd5B1AYB6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Mbd5B1AYB6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Mbd5B1AYB6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Mbd5B1AYB6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Mbd5B1AYB6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Mbd5B1AYB6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Mbd5B1AYB6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Mbd5B1AYB6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Mbd5B1AYB6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Mbd5B1AYB6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Mbd5B1AYB6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Mbd5B1AYB6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Mbd5B1AYB6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Mbd5B1AYB6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Mbd5B1AYB6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Mbd5B1AYB6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Mbd5B1AYB6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Mbd5B1AYB6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Mbd5B1AYB6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Mbd5B1AYB6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Mbd5B1AYB6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Mbd5B1AYB6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Mbd5B1AYB6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Mbd5B1AYB6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Mbd5B1AYB6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Mbd5B1AYB6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Mbd5B1AYB6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Mbd5B1AYB6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Mbd5B1AYB6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Mbd5B1AYB6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Mbd5B1AYB6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Mbd5B1AYB6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Mbd5B1AYB6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Mbd5B1AYB6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
Mbd5B1AYB6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Mbd5B1AYB6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Mbd5B1AYB6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
Mbd5B1AYB6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Mbd5B1AYB6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Mbd5B1AYB6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Mbd5B1AYB6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Mbd5B1AYB6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Mbd5B1AYB6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Mbd5B1AYB6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Mbd5B1AYB6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Mbd5B1AYB6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
Mbd5B1AYB6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Mbd5B1AYB6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
Mbd5B1AYB6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Mbd5B1AYB6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Mbd5B1AYB6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Mbd5B1AYB6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Mbd5B1AYB6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Mbd5B1AYB6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Mbd5B1AYB6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Mbd5B1AYB6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Mbd5B1AYB6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Mbd5B1AYB6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Mbd5B1AYB6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Mbd5B1AYB6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Mbd5B1AYB6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Mbd5B1AYB6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Mbd5B1AYB6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Mbd5B1AYB6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Mbd5B1AYB6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Mbd5B1AYB6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
Mbd5B1AYB6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
Mbd5B1AYB6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Mbd5B1AYB6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Mbd5B1AYB6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Mbd5B1AYB6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Mbd5B1AYB6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Mbd5B1AYB6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Mbd5B1AYB6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Mbd5B1AYB6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Mbd5B1AYB6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Mbd5B1AYB6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Mbd5B1AYB6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Mbd5B1AYB6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Mbd5B1AYB6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Mbd5B1AYB6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Mbd5B1AYB6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Mbd5B1AYB6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
Mbd5B1AYB6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Mbd5B1AYB6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Mbd5B1AYB6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Mbd5B1AYB6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Mbd5B1AYB6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Mbd5B1AYB6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Mbd5B1AYB6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Mbd5B1AYB6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Mbd5B1AYB6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Mbd5B1AYB6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Mbd5B1AYB6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Mbd5B1AYB6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms