Protein–RNA interactions for Protein: B1AV28

Gm14862, Predicted gene 14862, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm14862B1AV28 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm14862B1AV28 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm14862B1AV28 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm14862B1AV28 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm14862B1AV28 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm14862B1AV28 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm14862B1AV28 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm14862B1AV28 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm14862B1AV28 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm14862B1AV28 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm14862B1AV28 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm14862B1AV28 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm14862B1AV28 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm14862B1AV28 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm14862B1AV28 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm14862B1AV28 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm14862B1AV28 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm14862B1AV28 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm14862B1AV28 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm14862B1AV28 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm14862B1AV28 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm14862B1AV28 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm14862B1AV28 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm14862B1AV28 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm14862B1AV28 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm14862B1AV28 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm14862B1AV28 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm14862B1AV28 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm14862B1AV28 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm14862B1AV28 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm14862B1AV28 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm14862B1AV28 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm14862B1AV28 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm14862B1AV28 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm14862B1AV28 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm14862B1AV28 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm14862B1AV28 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm14862B1AV28 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm14862B1AV28 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm14862B1AV28 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm14862B1AV28 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm14862B1AV28 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm14862B1AV28 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm14862B1AV28 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm14862B1AV28 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm14862B1AV28 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm14862B1AV28 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm14862B1AV28 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm14862B1AV28 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm14862B1AV28 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm14862B1AV28 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm14862B1AV28 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm14862B1AV28 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm14862B1AV28 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm14862B1AV28 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm14862B1AV28 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm14862B1AV28 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm14862B1AV28 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm14862B1AV28 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm14862B1AV28 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm14862B1AV28 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm14862B1AV28 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm14862B1AV28 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm14862B1AV28 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm14862B1AV28 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gm14862B1AV28 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gm14862B1AV28 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm14862B1AV28 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm14862B1AV28 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm14862B1AV28 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm14862B1AV28 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm14862B1AV28 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm14862B1AV28 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm14862B1AV28 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm14862B1AV28 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm14862B1AV28 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm14862B1AV28 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm14862B1AV28 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm14862B1AV28 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm14862B1AV28 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm14862B1AV28 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm14862B1AV28 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm14862B1AV28 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm14862B1AV28 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm14862B1AV28 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm14862B1AV28 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm14862B1AV28 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm14862B1AV28 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm14862B1AV28 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm14862B1AV28 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm14862B1AV28 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm14862B1AV28 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm14862B1AV28 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm14862B1AV28 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm14862B1AV28 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm14862B1AV28 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm14862B1AV28 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm14862B1AV28 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm14862B1AV28 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm14862B1AV28 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms