Protein–RNA interactions for Protein: B1APN4

Rhox1, Reproductive homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox1B1APN4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rhox1B1APN4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rhox1B1APN4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rhox1B1APN4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rhox1B1APN4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rhox1B1APN4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rhox1B1APN4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rhox1B1APN4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rhox1B1APN4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rhox1B1APN4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rhox1B1APN4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rhox1B1APN4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rhox1B1APN4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rhox1B1APN4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhox1B1APN4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhox1B1APN4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhox1B1APN4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhox1B1APN4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rhox1B1APN4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rhox1B1APN4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rhox1B1APN4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rhox1B1APN4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rhox1B1APN4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rhox1B1APN4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rhox1B1APN4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rhox1B1APN4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rhox1B1APN4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rhox1B1APN4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rhox1B1APN4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rhox1B1APN4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rhox1B1APN4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rhox1B1APN4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rhox1B1APN4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rhox1B1APN4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rhox1B1APN4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rhox1B1APN4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rhox1B1APN4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rhox1B1APN4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rhox1B1APN4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rhox1B1APN4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rhox1B1APN4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rhox1B1APN4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rhox1B1APN4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rhox1B1APN4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rhox1B1APN4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rhox1B1APN4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rhox1B1APN4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rhox1B1APN4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rhox1B1APN4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rhox1B1APN4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rhox1B1APN4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rhox1B1APN4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rhox1B1APN4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rhox1B1APN4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rhox1B1APN4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rhox1B1APN4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rhox1B1APN4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rhox1B1APN4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rhox1B1APN4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rhox1B1APN4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rhox1B1APN4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rhox1B1APN4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rhox1B1APN4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rhox1B1APN4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rhox1B1APN4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rhox1B1APN4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rhox1B1APN4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rhox1B1APN4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rhox1B1APN4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rhox1B1APN4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rhox1B1APN4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rhox1B1APN4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rhox1B1APN4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rhox1B1APN4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rhox1B1APN4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rhox1B1APN4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rhox1B1APN4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rhox1B1APN4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rhox1B1APN4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rhox1B1APN4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rhox1B1APN4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rhox1B1APN4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rhox1B1APN4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rhox1B1APN4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rhox1B1APN4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rhox1B1APN4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rhox1B1APN4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rhox1B1APN4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rhox1B1APN4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rhox1B1APN4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rhox1B1APN4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rhox1B1APN4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rhox1B1APN4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rhox1B1APN4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rhox1B1APN4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rhox1B1APN4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Rhox1B1APN4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rhox1B1APN4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rhox1B1APN4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rhox1B1APN4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms