Protein–RNA interactions for Protein: A7XUX6

Skint2, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint2A7XUX6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Skint2A7XUX6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Skint2A7XUX6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Skint2A7XUX6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Skint2A7XUX6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Skint2A7XUX6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Skint2A7XUX6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Skint2A7XUX6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Skint2A7XUX6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Skint2A7XUX6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Skint2A7XUX6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Skint2A7XUX6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Skint2A7XUX6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Skint2A7XUX6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Skint2A7XUX6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Skint2A7XUX6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Skint2A7XUX6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Skint2A7XUX6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Skint2A7XUX6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Skint2A7XUX6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Skint2A7XUX6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Skint2A7XUX6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Skint2A7XUX6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Skint2A7XUX6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Skint2A7XUX6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Skint2A7XUX6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Skint2A7XUX6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Skint2A7XUX6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Skint2A7XUX6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Skint2A7XUX6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Skint2A7XUX6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Skint2A7XUX6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Skint2A7XUX6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Skint2A7XUX6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Skint2A7XUX6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Skint2A7XUX6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Skint2A7XUX6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Skint2A7XUX6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Skint2A7XUX6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Skint2A7XUX6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Skint2A7XUX6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Skint2A7XUX6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Skint2A7XUX6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Skint2A7XUX6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Skint2A7XUX6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Skint2A7XUX6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Skint2A7XUX6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Skint2A7XUX6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Skint2A7XUX6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Skint2A7XUX6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Skint2A7XUX6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Skint2A7XUX6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Skint2A7XUX6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Skint2A7XUX6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Skint2A7XUX6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Skint2A7XUX6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Skint2A7XUX6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Skint2A7XUX6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Skint2A7XUX6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Skint2A7XUX6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Skint2A7XUX6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Skint2A7XUX6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Skint2A7XUX6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Skint2A7XUX6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Skint2A7XUX6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Skint2A7XUX6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Skint2A7XUX6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Skint2A7XUX6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Skint2A7XUX6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Skint2A7XUX6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Skint2A7XUX6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Skint2A7XUX6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Skint2A7XUX6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Skint2A7XUX6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Skint2A7XUX6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Skint2A7XUX6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Skint2A7XUX6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Skint2A7XUX6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Skint2A7XUX6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Skint2A7XUX6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Skint2A7XUX6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Skint2A7XUX6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Skint2A7XUX6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Skint2A7XUX6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Skint2A7XUX6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Skint2A7XUX6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Skint2A7XUX6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Skint2A7XUX6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Skint2A7XUX6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Skint2A7XUX6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Skint2A7XUX6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Skint2A7XUX6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Skint2A7XUX6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Skint2A7XUX6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Skint2A7XUX6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms