Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf39A2RT81 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf39A2RT81 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf39A2RT81 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf39A2RT81 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf39A2RT81 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf39A2RT81 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf39A2RT81 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf39A2RT81 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf39A2RT81 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf39A2RT81 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf39A2RT81 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf39A2RT81 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf39A2RT81 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf39A2RT81 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf39A2RT81 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf39A2RT81 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf39A2RT81 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf39A2RT81 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf39A2RT81 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf39A2RT81 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf39A2RT81 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf39A2RT81 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf39A2RT81 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf39A2RT81 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf39A2RT81 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf39A2RT81 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf39A2RT81 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf39A2RT81 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf39A2RT81 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rnf39A2RT81 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf39A2RT81 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf39A2RT81 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf39A2RT81 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf39A2RT81 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf39A2RT81 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf39A2RT81 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf39A2RT81 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf39A2RT81 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf39A2RT81 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf39A2RT81 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf39A2RT81 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf39A2RT81 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf39A2RT81 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf39A2RT81 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf39A2RT81 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf39A2RT81 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf39A2RT81 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf39A2RT81 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf39A2RT81 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf39A2RT81 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf39A2RT81 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf39A2RT81 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf39A2RT81 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf39A2RT81 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf39A2RT81 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf39A2RT81 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf39A2RT81 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rnf39A2RT81 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf39A2RT81 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf39A2RT81 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf39A2RT81 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf39A2RT81 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf39A2RT81 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf39A2RT81 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf39A2RT81 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf39A2RT81 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf39A2RT81 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf39A2RT81 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf39A2RT81 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf39A2RT81 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf39A2RT81 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf39A2RT81 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf39A2RT81 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf39A2RT81 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf39A2RT81 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf39A2RT81 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf39A2RT81 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf39A2RT81 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf39A2RT81 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf39A2RT81 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf39A2RT81 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf39A2RT81 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf39A2RT81 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf39A2RT81 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf39A2RT81 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf39A2RT81 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf39A2RT81 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf39A2RT81 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf39A2RT81 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf39A2RT81 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf39A2RT81 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf39A2RT81 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf39A2RT81 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf39A2RT81 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf39A2RT81 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf39A2RT81 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf39A2RT81 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf39A2RT81 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf39A2RT81 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms