Protein–RNA interactions for Protein: A2RSL7

4931406B18Rik, RIKEN cDNA 4931406B18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931406B18RikA2RSL7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
4931406B18RikA2RSL7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4931406B18RikA2RSL7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
4931406B18RikA2RSL7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
4931406B18RikA2RSL7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
4931406B18RikA2RSL7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
4931406B18RikA2RSL7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4931406B18RikA2RSL7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4931406B18RikA2RSL7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
4931406B18RikA2RSL7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4931406B18RikA2RSL7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4931406B18RikA2RSL7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
4931406B18RikA2RSL7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4931406B18RikA2RSL7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4931406B18RikA2RSL7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4931406B18RikA2RSL7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4931406B18RikA2RSL7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
4931406B18RikA2RSL7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4931406B18RikA2RSL7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4931406B18RikA2RSL7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
4931406B18RikA2RSL7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4931406B18RikA2RSL7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4931406B18RikA2RSL7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4931406B18RikA2RSL7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4931406B18RikA2RSL7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4931406B18RikA2RSL7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4931406B18RikA2RSL7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4931406B18RikA2RSL7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
4931406B18RikA2RSL7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4931406B18RikA2RSL7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4931406B18RikA2RSL7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
4931406B18RikA2RSL7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4931406B18RikA2RSL7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
4931406B18RikA2RSL7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4931406B18RikA2RSL7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4931406B18RikA2RSL7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
4931406B18RikA2RSL7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
4931406B18RikA2RSL7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4931406B18RikA2RSL7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4931406B18RikA2RSL7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4931406B18RikA2RSL7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4931406B18RikA2RSL7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
4931406B18RikA2RSL7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4931406B18RikA2RSL7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4931406B18RikA2RSL7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
4931406B18RikA2RSL7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4931406B18RikA2RSL7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4931406B18RikA2RSL7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
4931406B18RikA2RSL7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4931406B18RikA2RSL7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4931406B18RikA2RSL7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4931406B18RikA2RSL7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4931406B18RikA2RSL7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
4931406B18RikA2RSL7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4931406B18RikA2RSL7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
4931406B18RikA2RSL7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4931406B18RikA2RSL7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4931406B18RikA2RSL7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
4931406B18RikA2RSL7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
4931406B18RikA2RSL7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4931406B18RikA2RSL7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4931406B18RikA2RSL7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
4931406B18RikA2RSL7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4931406B18RikA2RSL7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
4931406B18RikA2RSL7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4931406B18RikA2RSL7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4931406B18RikA2RSL7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4931406B18RikA2RSL7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4931406B18RikA2RSL7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
4931406B18RikA2RSL7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4931406B18RikA2RSL7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4931406B18RikA2RSL7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
4931406B18RikA2RSL7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4931406B18RikA2RSL7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4931406B18RikA2RSL7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
4931406B18RikA2RSL7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4931406B18RikA2RSL7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4931406B18RikA2RSL7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4931406B18RikA2RSL7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4931406B18RikA2RSL7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
4931406B18RikA2RSL7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
4931406B18RikA2RSL7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4931406B18RikA2RSL7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
4931406B18RikA2RSL7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4931406B18RikA2RSL7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
4931406B18RikA2RSL7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
4931406B18RikA2RSL7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4931406B18RikA2RSL7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4931406B18RikA2RSL7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4931406B18RikA2RSL7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4931406B18RikA2RSL7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
4931406B18RikA2RSL7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4931406B18RikA2RSL7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4931406B18RikA2RSL7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4931406B18RikA2RSL7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4931406B18RikA2RSL7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
4931406B18RikA2RSL7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4931406B18RikA2RSL7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4931406B18RikA2RSL7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4931406B18RikA2RSL7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 216.6 ms